商业呐喊 MiSeq™ i100系列基因测序仪——新一代桌面式基因测序仪 全栈AI赋能，最快2小时！华大智造发布DNBSEQ-E25 Flash闪速测序方案 全新体验！思昆生物发布Sikun RapidGS480基因测序仪 新品速递丨赛陆医疗Saluseq Nimbo：上市即瞩目，开启测序新篇章！ 呐喊的背后 Illumina | MiSeq i100基因测序仪：最快4 h（SE100） 华大智造 | DNBSEQ-E25 Flash测序仪：最快2 h（SE50） 思昆生物 | Rapid GS480基因测序仪：最快2.5 h（SE50） 赛陆医疗 | Saluseq Nimbo 基因测序仪：最快3.4 h（SE50） 01 下个定义 单端测序（Single-End, SE）：只从DNA片段的一端读取序列（如SE50=单条50 bp读长）； 双端测序（Paired-End, PE）：从同一DNA片段的两端各读一次（如2×150 bp=两端各150bp读长）； 什么是读长？ 测序读长是指每条已测序DNA片段的长度，可以是单端测序，也可以是双端测序。例如，设置2x150bp进行测序，每个DNA片段可生成2条150bp长度的读数(正向反向各一条)。较长的读长，有利于检测DNA序列中跨越重复区域，而较短的读长，则对于那些对基因组覆盖无要求的计数方法学相关应用更具性价比。 02 单端？双端？你怎么选？ 从几个维度我们来看看： 双index的文库也可选择单端测序，即单端文库和双端文库可混合一起上机测序 03 单端和双端的应用场景 选择单端测序： ’RNA-Seq转录本定量：只需基因表达计数，无需结构信息。 ’快速病原检测：华大智造披露，国内某疾病预防控制中心采用华大智造猴痘全基因组靶向建库方案结合E25 Flash闪速测序方案，仅用时9小时就完成了猴痘病例的正确分型，获得组装完整的病毒全长基因组（SE100+10读长，测序时间3.3小时）。 ’预算有限项目：成本比双端低30%-50%（保守估计）。 选择双端测序： ’基因组De Novo组装：跨越重复区，避免“碎片化”拼图（如人全基因组）； ’结构变异检测：精准捕捉染色体倒位、易位； ’转录组或宏基因组分析：复杂微生物群落需高精度定位。 最后的话 “天下武功，唯快不破” ——但基因测序的江湖里，快（单端）与准（双端）从来不是单选题！临床急救选单端，科研深水区用双端，而未来的长读长技术正在不远处招手。看完这文，下次选测序策略时，你还会纠结选什么不（还是会纠结，哈哈哈） |
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