北京时间2019年11月20日,Quadrant和Admera两家公司联合推出全球首个基于唾液的自闭症临床分子检测产品Clarifi™。此产品基于美国国立卫生研究院和美国儿科学会资助的科研成果转化,通过二代测序分析人非编码RNA和微生物组RNA,并利用机器学习算法整合多组学和临床信息。 图:Clarifi™团队官方推广邮件(来源/Admera) 图:来源/Clarifi™官网 自闭症,又称为孤独症。医学称之为“孤独症谱系障碍”(Autism Spectrum Disorder),即ASD,是一种由神经系统失调导至的发育障碍。常常发病于婴幼儿时期,大部分伴有精神发育迟滞,而且发病率较高(美国约1.7%,中国约1%)。 自闭症特点: 1)发病早 对于自闭症的病因和治疗,目前在医学上仍然是没有确切的定论和方法。因此,早期诊断和及早干预显得尤为重要,可以帮助患者减轻病症或防止恶化。 理论上自闭症可以在2岁之前被诊断出,但实际临床上平均诊断年龄已经超过了4岁。因此,临床一线亟需可以更好的工具来进行早期诊断。Clarifi™自闭症唾液检测应时而生。 正因为自闭症与遗传因素的紧密联系,早在2009年,罗马天主教大学的Massimo Castagnola教授分析了27名自闭症儿童和23名同龄健康儿童的唾液样本。发现自闭症儿童的唾液中有至少2/3的肽不同于健康儿童。这项研究发表在《Journal of Proteome Research》期刊上。不过当时作者表示还需要在更大的人群中进行验证[4]。 紧接着在2015年,克拉克森大学(Clarkson University)的一名学生 Armand Gatien Ngounou Wetie 对6名孤独症儿童(6~16岁)的唾液样本进行分析,并与同龄健康儿童对比,通过质谱分析发现孤独症患者唾液中的9种蛋白水平明显升高,3种比较低或没有[5]。该项成果发表在《Autism Research》上,作者因此获得该校的特别嘉奖。 除了发现多肽和蛋白等标记物,科学家还发现了自闭症和小RNA的关联。2018年。宾夕法尼亚州立大学医学院的Steven Hicks在《Frontiers in Genetics》上发表研究表明[6],基于唾液的32种小RNA检测板(panel)能够帮助早期诊断自闭症,特别是将自闭症儿童与发育迟缓儿童区分开,准确率为85%。 与此同时,多年来由NIH资助的研究也发现了自闭症和RNA的关联。科学家发现了一组人类和微生物RNA,可将自闭症的儿童与非自闭症发育迟缓的儿童(通常是发育中的儿童)准确区分开。 基于这项突破性的研究开发出来的机器学习算法,正是Clarifi™自闭症唾液检测的核心之一。 图:Clarifi™产品流程图(来源/Clarifi™官网) 参考资料: 1) http://www.clarifiasd.com 2) https://mp.weixin.qq.com/s/jgl8mgv4JyLASXt161tmsg 3)“中国“自闭症”患者超千万 发病率逐年攀升” ,中国新闻网 4)Massimo Castagnola*Irene MessanaRosanna Inzitari et. al., Hypo-Phosphorylation of Salivary Peptidome as a Clue to the Molecular Pathogenesis of Autism Spectrum Disorders,Journal of Proteome Research 2008, 7, 12, 5327-5332 5)Armand G. Ngounou Wetie, Kelly L. Wormwood et.al., A Pilot Proteomic Analysis of Salivary Biomarkers in Autism Spectrum Disorder. Autism Research, 2015; DOI: 10.1002/aur.1450 6) Steven D. Hicks, Alexander, Rajan, Kayla E. Wagne et.al., Validation of a Salivary RNA Test for Childhood Autism Spectrum Disorder, Front. Genet., 2018 (封面图来源/Clarifi™官网) |