预测蛋白结构的准确率是如何量化的，冷冻电镜和alphafold的准确率分别如何？

千姿百态

rt

原文地址：https://www.zhihu.com/question/919183771

长长的路

一般以晶体结构为准，如果没有晶体结构就认为（有人参与的）结构为准，比如人手动标注的cryoEM的结构
Alphafold对于大型复合物，RNA的准确度并没有达到完美，CryoEM对于分辨率低的结构同样不太能用

长长的路

如果没有实验结果，我们永远无法真正的知道alphafold对于未知蛋白质结构预测的准确率，因为准确率的定义就是基于预测和实际的比较。但在统计学上，我们可以在已知结构的蛋白质里面，对这个算法准确率进行评估，比如cross validation等等。