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液体活检的目标与方法
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液体活检的目标与方法
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发表于 2025-1-26 10:09
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肿瘤的液体活检主要包括循环肿瘤DNA(ctDNA)、游离肿瘤细胞(CTC)及外泌体(exosome)。众多研究表明三者与肿瘤的早诊、治疗、预后等均存在相关性。
目前在临床应用最多的当属ctDNA检测。
正常人的体液内亦存在来自于机体正常细胞的游离DNA,简称循环游离DNA或cfDNA;在肿瘤患者体内,循环游离DNA不仅仅来自于正常细胞,还有一部分来自于肿瘤细胞,即ctDNA,也是循环游离DNA的一部分,因此我们可以通过检测ctDNA相关变异状态作为来自肿瘤细胞的标志物。
目前临床肿瘤ctDNA检测最常见的应用领域为治疗方案选择及耐药监测。
由于ctDNA具有片段化程度高、丰度低等特点,其主流检测方法包括Cobas法、Super-ARMS法、高通量二代测序(NGS)及数字PCR。
液体活检的运用与优势
液体活检最大的优势在于微创、快捷,易于动态监测;一定程度上全面反映肿瘤整体变异状态,不受肿瘤异质性影响;适用人群更广泛,对于难以取得活检肿瘤组织或取得肿瘤组织不够基因检测的患者,液体活检提供了一个了解肿瘤基因变异状态的有效途径。
1. 早期诊断
肿瘤的早期诊断最大难点是由于肿瘤负荷很低,可能影像学上没有明确的病灶,此时血液中ctDNA的含量亦极低,普通针对ctDNA突变的检测难以满足早诊的要求。
但DNA甲基化改变是贯穿整个恶性转化的表观遗传学改变。即使在肿瘤发展的最早期,DNA甲基化模式也已经与正常细胞存在显著差异;其次,甲基化水平的改变是具有组织特异性的,即对甲基化进行检测及比对,能够进行器官溯源,发现到底是哪里可能会发生或已经发生了肿瘤。
因此,对ctDNA的甲基化水平进行检测,是一种有效的肿瘤早期筛查辅助手段。比如SEPT9基因甲基化检测试剂盒对结直肠癌诊断的敏感度及特异性可达74.8%及97.5%[1],现在已经可以作为一种结肠镜前的初筛手段。
2. 指导靶向治疗
肿瘤的靶向治疗是目前临床最常见的ctDNA检测应用。根据《非小细胞肺癌血液EGFR基因突变检测中国专家共识》,如果有肿瘤组织,推荐使用肿瘤组织进行驱动基因检测;若无肿瘤组织样本或肿瘤组织样本不足的情况下,液体活检可作为很多患者基因检测的首选。无论何种检测方式,应注意的是若组织活检或者液体活检有任何一个是阳性,患者应当考虑使用靶向药物;当液体活检先行的时候,若液体活检为阴性,应提示患者可能存在假阴性,必要时再取活检,以避免错失可能的靶向治疗机会。
3.
耐药监测
靶向治疗终归面临耐药的问题,而液体活检由于微创快捷的优势,是理想的耐药监测材料。对于EGFR一代或者二代TKI用药人群,约半数以上的患者出现EGFR 20号外显子T790M而耐药,因此对于此类患者的耐药监测可使用敏感度高且成本低的数字PCR法对T790M单点进行监测。如果患者已经出现了耐药,亟需探索其耐药机制以更换治疗方案,此时推荐使用NGS对基因变异的整体状态进行检测,以便全面寻找耐药原因。
4. 预后评估
在预后评估方面,微小残留病变(MRD)是目前研究的热点。MRD指的是治疗后传统影像学和实验室方法无法发现,但通过分子诊断可以发现的肿瘤来源的分子异常。多种肿瘤的相关研究表明,ctDNA突变状态可提示接受根治性治疗的患者的预后复发,并且已经在部分临床实验中得到应用。
液体活检的样本采集要求
血液的规范化处理是保证液体活检结果准确的基本前提。在血液样本的送检方面应注意:
1.采血管的选择
ctDNA检测的血液需使用EDTA抗凝管或者cfDNA专用采血管。若使用EDTA抗凝管,血液离体后应尽量保存于4℃,2小时内需尽快进行血浆分离;若使用cfDNA专用采血管,血液可在常温保存3-5天。切记严禁使用肝素抗凝管,因为肝素在后续DNA提取过程中难以去除,并且会抑制PCR反应,导致后续ctDNA检测失败。
2.采血量及采血注意事项
一般而言,ctDNA检测需要采集8-10ml的全血。采血后严禁剧烈震荡血液,或者使用注射器针头对血液进行转移,因为这样的操作均会导致血液中细胞破裂,从而造成基因组DNA的污染,增加ctDNA检测的假阴性。采血后应轻柔将采血管颠倒8-10次进行混匀。
3. 患者采血时间的选择
一般建议患者空腹进行抽血,特别是血脂较高的患者。这是由于低密度脂蛋白对荧光有屏蔽和吸收的作用,会干扰后续ctDNA的相关检测;三酰甘油会降低ctDNA的提取率;若使用微滴式数字PCR检测技术,血液中的脂质会影响后续微滴的生成。此外,对于正在进行化疗的患者,一般建议患者化疗结束后进行抽血。
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