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PCR实验小问题①——非特异性扩增
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发表于 2024-10-25 17:43
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聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)具有特异性强、敏感度高、快速简便、自动化等优点,它可以在一个试管内将我们想要的目的DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍,再通过某种技术手段使得实验结果能够肉眼能直接观察和判断,是生物科学史上极具里程碑意义的实验方法。目前来看,最为基础普遍的就是普通PCR技术了,即在反应结束后使用凝胶电泳观察实验结果的技术方法。但是并不是每一次的试验结果都非常的完美简洁,或多或少会出现一些问题,比如非特异性扩增。非特异性扩增就是结果出现与目的条带大小不一致的扩增带,大大小小,几条至十几条都有可能。那么是什么导致了非特异性扩增条带的出现呢?往下看看你就知道啦!
1. 引物。非特异性条带的出现,最大的可能就是引物出现了问题,①引物聚合形成二聚体,会导致100bp左右的位置出现弥散的低亮度条带,②引物与目的DNA序列非特异性互补,即在目的DNA序列上有多个位点均能和引物进行互补配对,导致扩增条带出现多条。可以先小幅减少引物添加量试一下,必要的时候要重新设计引物哦!
2. 模板。模板致使非特异性扩增出现的原因有两种:①模板不纯,样本本身可能有污染,提取核酸过程或实验过程操作不当导致模板或整个反应体系被污染。②模板出现降解,降解后的DNA片段不够完整,自然跑不出我们想要的目的片段。③模板量过大,也会导致非特异性扩增。所以在实验前,我们应该电泳检查模板的完整性和浓度,适当添加模板即可。
3. Mg2+浓度。Mg2+浓度过高会导致大量的非特异性扩增。
4. 反应程序。①循环次数太多的话,目的片段的数目会增加,但是引物非特异性结合,以及聚合酶活性下降导致的非特异性扩增比例也会上升。所以PCR循环次数一般在30个左右较佳。②退火温度过低或时间过短,也会导致引物间结合形成二级结构。
PCR技术说简单也简单,说复杂也很复杂,一点小的不足就很有可能与正确结果擦肩而过,此之谓牵一发而动全身。所以严谨的试验态度非常重要,同样重要的还有优质的试剂与仪器。三狮生物2×Taq PCR Master Mix(Taq酶预混液),科学配比添加了DNA Ploymerase、PCR Buffer及dNTP Mix等多种PCR原料,有含染料与不含染料(电泳时所必需的色素试剂)两种供您选择,您只需要添加模板、上游引物、下游引物和dd水便可进行PCR反应,灵敏度高,特异性强,线性范围广,简单方便,为您的试验保驾护航!
原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/578498261
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