99 美元的家用测序仪？！

营养师

那个无法停止创办测序公司的神人乔纳森·罗斯伯格（Jonathan Rothberg）又披露了开源测序仪公司454.bio。








他受到受到社区构建开源大语言模型的启发。这些设计使得 99 美元的家用测序仪成为可能，借助开源LLM，这一测序仪将成为“盒子里的通用医生”。在大流行之前，希望全世界有数10 万个这样的设备！




当 Ion Torrent 被用来发现 Omicron病毒变体时，他受到触动，确保下次我们可以撒下更广泛的监测网。而454.bio这才刚刚开始。
454.bio近期所更新的内容基本上处于概念验证阶段。
干货来了！手把手教你打造搭建自己的DNA测序仪！

消息一经发出，人们发现所谓的开源试剂订购需要3万多美元，很多人惊叹这太离谱了。
随后，Rothberg在推特上出面澄清，搞错了，50 次运行995 美元，每次运行20美元。试剂价格为 2 美元，墨盒价格为20 美元以下。随后网站也更新了相应的价格：60 次运行 1300 美元。




Rothberg称，只有使用新的聚合酶才能获得良好的读长（100碱基以上）。因此，公司对优先掺入 LT 的聚合酶给予 20 万美元的奖励。
目前的光学器件具有6微米分辨率和小视场。开源之后，希望大家用低成本光学器件进行改进。如果有好的设计，他认为富士康的制造成本可以低于100美元。
也有人抱怨说，测序底物基板的准备不适合胆小的人：pirhana酸溶液、真空炉、微阵列点样器、定制石英基板等等。Rothberg回应称，我们来提供基材，还需要提供什么其他东西？
也有人问：我只是想知道未来的道路是使其具有行业竞争力还是教育性？如果目标受众是车库实验室或高中/大学，用于 DIY 试剂的成本还是一笔很大的开支。Rothberg说，很快50次反应的成本就会跌到100美元。当然，如果专注于家庭和护理点使用场景，通过454.bio的测序，希望在 2 小时内（最终 20 分钟）内取样并得到答案。
454 Bio 与 454 Life Sciences果然有某种关系。虽然这是一家新公司，采用完全不相关的技术，但Rothberg买回了454的商标。
之前的454焦磷酸测序已经死了，这次的454一锅测序才刚刚起航。
同样，闪电终止子相关的所有专利、商标和技术也被Rothberg买回来了。现在454拥有Lasergen/安捷伦/Michael L. Metzker课题组这些IP的独家授权。






Lasergen/安捷伦专利所覆盖的闪电终止子类型





Lasergen所选用的四色闪电终止子





454.bio的LT设计，来自于Lasergen专利的授权

插播一句的是，通过空间位阻进行反应终止的3‘-OH未阻断修饰核苷酸，除了这里讲到的闪电终止子以外，之前进行商业化的还有Helicos BioSciences的“虚拟终止子”，被第一个单分子测序仪所使用。闪电终止子的独特之处在于利用紫外光裂解荧光基团。




几种商业可逆终止子。红色的化学结构表示可逆终止基团。箭头表示将荧光基团与核苷酸分开的裂解位点，蓝色的化学结构表示附着在碱基上的分子疤痕。图D为虚拟终止子，E为闪电终止子。
至于20万美元的聚合酶竞赛奖励，各说纷纭。
有的人觉得一项可能带来数十亿美元收入的发明却只获得20万美元的象征性收入，没有版税和其他衍生产物的权利及可能的销售分成，太不合理了。任何聪明到能够将聚合酶进化到这些规格的人都不会愚蠢到接受这笔交易。
有人说，我可以参加这个竞赛，但没有资源来实际运行检测，20万美元能不能覆盖我所付出的这些时间和费用？
但对于那些已经做过各种聚合酶进化改造的人来说，或许回去翻一翻，指不定也能从原本躺着的试剂里赚取一笔奖金？




Anyway，99美元的家用测序仪，这是真的吗？有生之年？
你让ONT MinION怎么想？


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