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[生化]多功能酶一定是是单体酶吗?
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[生化]多功能酶一定是是单体酶吗?
原文地址:https://www.zhihu.com/question/661458972
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雷达卡
发表于 2024-9-14 13:32
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多功能酶并不一定是单体酶。
多功能酶指的是具有多种催化功能的酶,它能够催化多个不同的化学反应。这种酶可以在一个分子内具有多个催化域,每个催化域负责一种特定的反应。因此,多功能酶可以在一个单一的蛋白质分子中执行多个生物化学反应。
单体酶则是指那些只由单一亚基(或肽链)构成的酶,与之相对的是寡聚酶,由多个相同或不同的亚基以非共价键连接而成。
多功能酶可以是单体酶,也可以是寡聚酶,这取决于它的分子构成。如果多功能酶只由一条肽链构成,并且这条肽链上包含多个催化域,那么它就是单体酶。但如果多功能酶由多个亚基构成,那么它就是寡聚酶。
总的来说,多功能酶与单体酶或寡聚酶的区分是基于其分子构成,而不是其功能多样性。因此,不能简单地将多功能酶等同于单体酶。
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雷达卡
发表于 2024-9-14 13:33
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多功能酶不一定必须是单体酶。多功能酶可以是单体酶,但更常见的是由多个亚基组成的寡聚酶或复合酶。不同的结构形式都可以实现多功能性
酶的基础概念
酶是生物体内一种非常重要的蛋白质分子,它们扮演着生物催化剂的角色,能够显著加速生化反应而不被自身消耗。酶的两大核心特征是高效性和特异性。
酶的结构类型
酶按结构可以分为几大类:
单体酶(monomeric enzyme)
这是由一条单独的多肽链(也就是一条长链氨基酸)组成的酶。这条肽链通过折叠形成了酶的三维结构,这个结构直接关系到酶的催化活性。
寡聚酶(oligomeric enzyme)这类酶由两个或更多个亚基组成,每个亚基同样是一条或多条肽链。这些亚基可以通过非共价相互作用聚集在一起,共同协作执行催化任务。根据亚基的相似性,寡聚酶又可分为同源寡聚酶和异源寡聚酶。
多功能酶(
multifunctional enzyme
)
是指具有多种催化活性的酶,即同一酶分子可以催化不同的化学反应。这些酶在生物体内发挥重要作用,因为它们可以通过单一酶分子执行多个步骤,从而提高反应效率和调节复杂代谢路径。
多功能酶的结构多样性
多功能酶可以是单体酶,但并不局限于此。许多多功能酶实际上是寡聚酶或复合酶,由多个亚基组成。每个亚基可能具有不同的催化活性,或者通过相互作用实现多功能性。
脂肪酸合酶(Fatty Acid Synthase)
:这是一个典型的多功能酶,参与脂肪酸的合成。脂肪酸合酶是一个大型多亚基复合物,每个亚基具有不同的催化功能,协同完成一系列反应步骤。
DNA聚合酶(DNA Polymerase)
:有些DNA聚合酶不仅具有聚合酶活性,还具有校对功能(3'→5'外切酶活性)。这些酶通常是寡聚酶,通过不同的亚基实现多功能性。
单体多功能酶的例子
尽管许多多功能酶是寡聚酶,也存在一些单体多功能酶。例如,一些单个蛋白质分子可以折叠成多个功能域(domains),每个功能域执行不同的催化活性
多功能酶与单体酶的关系
并不是所有的多功能酶都是单体酶。理论上,一个寡聚酶也可以是多功能酶,只要它的不同亚基或者同一个亚基的不同区域能够分别催化不同的反应。但是,常见的多功能酶例子往往基于单体酶,因为在一个单独的多肽链上实现多种催化活性,从结构上看更为直观和简洁。
酶的分类
定义
特点
单体酶
由单一多肽链组成的酶。
简单结构,催化活性依赖于单一肽链的特定区域。
寡聚酶
由两个或多个亚基构成,亚基可以是相同的,也可以不同。
结构更复杂,亚基间的相互作用影响催化效率和特异性。
多酶复合体
几种不同酶组成的复合体,共同参与连续的生化反应。
高度组织化,能有效协调多步骤反应,提高整体催化效率。
多功能酶
具有两种或以上催化活性的酶,无论单体还是寡聚体。
在单一分子中整合多种催化功能,提高代谢效率。
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发表于 2024-9-14 13:34
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生化多功能酶一定是是单体酶吗?酶是大分子,其分子量一般在一万以上,由数百个氨基酸组成。而酶的底物一般很小,直接与底物接触并起催化作用的只是酶分子中的一小部分。即使有些酶的底物较大,但与酶接触的也只是一个很小的区域。所以,我们把酶分子中与底物结合并催化反应的场所称为酶的活性中心。
活性中心是由酶分子中少数几个残基构成的,它们在一级结构上可能相距很远,甚至位于不同的肽链上,由于肽链的盘曲折叠而互相接近,构成一个特定的活性结构。因此活性中心不是一个点或面,而是一个小的空间区域。
活性中心的氨基酸按功能可分为底物结合部位和催化部位。前者负责识别特定的底物并与之结合。它们决定了酶的底物专一性。后者是起催化作用的,底物的敏感键在此被切断或形成新键,从而生成产物。二者的分别并不是绝对的,有些基团既有底物结合功能又有催化功能。
Koshland将酶分子中的残基分为四类:接触亚基负责底物的结合与催化,辅助亚基起协助作用,结构亚基维持酶的构象,非贡献亚基的替换对活性无影响,但对酶的免疫、运输、调控与寿命等有作用。前二者构成活性中心,前三者称为酶的必须基团。
活性中心以外的部分并不是无用的,它们能够维持酶的空间结构,使活性中心保持完整。在酶与底物结合后,整个酶分子的构象发生变化,这种扭动的张力使底物化学键容易断裂。这种变化也要依靠非活性中心的协同作用。
一般单体酶只有一个活性中心,但有些多功能酶具有多个活性中心。大肠杆菌DNA聚合酶I是一条109 kd的肽链,既有聚合酶活性,又有外切酶活性。下图是一种芽孢杆菌的DNA聚合酶I,聚合酶活性中心位于左侧与DNA结合的结构域,外切酶活性中心位于右侧结构域。
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