你知道DNA测序, 可是RNA测序呢？

检验之星

导语

为什么肿瘤细胞与正常细胞会不一样？光说“基因突变”是不够的。其实这个问题有点复杂...

一般，某一个物种体内所有细胞里含有的DNA都应该是一模一样的，只是因为每一种细胞里所表达的RNA之间存在差异，才使这些细胞有所区别。

可是“为什么肿瘤细胞与正常细胞会不一样？”

这样的重要问题不仅仅涉及到DNA的突变，还必须通过不同细胞里的RNA来研究解决，这就需要用到RNA测序技术。

DNA测序的升级版

RNA测序首先需要提取生物样品中全部的RNA，然后反转录为c-DNA后进行高通量测序。

但相较于一个静态的染色体而言，细胞内的转录物组其实是一个处于不断变化的动态过程。随着这项技术的发展，RNA测序不仅能检测mRNA的转录，还能观测到包括包括总RNA和小RNA（miRNA、tRNA和核糖体RNA）在内不同尺度的RNA表达谱。

通过对RNA的研究，研究人员希望可以确定一些细胞类型是在何时何地开启和关闭基因的。这对于许多疾病的研究非常有帮助。

RNA的3D样式图

RNA测序 VS 微阵列

然而，自RNA测序诞生以来，它就不得不面对微阵列技术爱好者的争论。该技术是基因组学领域的一项重要突破技术，也是研究转录本信息的常规方法。

RNA测序之所以是一个理想的检测平台，因为它有能力对新的转录进行无偏差的检测，这就意味着它不需要特异性的探针。所以RNA测序的适应性要强于微阵列。

从临床的角度看，RNA测序提供了较低的信噪比，并且能够以更强的特异性和敏感性检测出较少或者较低丰度的转录本。这对于临床医生来说是非常可贵的。

在很多情况下，两种技术可以结合起来对转录组进行更精确的评估。特别是，很多RNA测序协议尚未标准化，研究人员可以使用微阵列来验证测序的结果。

待建立的标准

但是，RNA测序想要从一个纯粹的分析方法变成临床检测工具，科学家和监管人员必须制定标准的分析方法和基准数据，以确保检测的准确性和重现性。

尽管，有很多出版物和会议以评估RNA测序平台、具体的实验室协议和数据分析软件为主题，但是目前还远没有达成共识。

去年10月，FDA在其网站上公布了美国国会关于实验室开发诊断测试（LDTs）和伴随诊断规范的指导草案的细节，其中将包括RNA测序。这对于RNA测序被用作重要的临床诊断工具是非常重要的一步。

RNA与精准医疗

著名的梅奥诊所最近开发了一个叫MAP-RSeq分析途径，该途径集合了一套生物信息学工具，通过一种内部开发的方法分析双末端（Paired-End）RNA测序数据。

由于RAN测序对不同的临床病症适应性很强，很多科学家和出版物指出RNA测序在临床上将用于各种类型的癌症。

如果说实验室开发阶段为RNA测序应用于临床的能力设定了一个基数，那么随着精准医疗时代的到来，未来几年这个基数会无限扩大。如果科学家们能够尽快制定标准的实践方案，使RNA测序能够处理大量的临床工作，这将对精准医疗至关重要。

来源：HI基因