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[分享] Hiseq X ten测序服务常见问题及回答

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发表于 2014-7-5 01:53 | 显示全部楼层 |阅读模式

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  • 问:Illumina HiSeq X10可以测什么样本?

答:X10专门用于测人全基因组的重测序。

X10不可以用于测:人以外任何物种的文库。不可以用于测人的非全基因组项目,例如:人全基因组甲基化Bisulfite处理文库、或者人的全外显子文件、人的RNA文库。


  • 问:X10可以测什么文库?

答:Illumina规定,X10只可以测用Illumina Truseq Nano试剂盒建的人全基因组文库。


  • 问:X10文库的插入片段是多少bp?

答:X10文库的插入片段是以350bp为主的插入片段。


  • 问:X10的测序数据产量是多少?

答:X10每个样本至少要测90G PF data。Illumina公司保证每个文库在正常上机条件下,可以产出90G PF data,如果少于90G PF data,Illumina包赔。也就是说:X10可以测大于等于90G/文库的数据量,不可以测少于90G的数据量。


  • 问:X10交付的是什么数据?什么文件格式?

答:X10交付的是PF数据。注意:不是Cleandata。

交付的文件格式是FASTQ文件。

  • 问:X10对样本的数量、质量如何要求?

答:要求:


    • 人全基因组DNA>2ug;
    • 浓度大于50ng/uL;
    • OD 260/280 在1.8~2.0之间。

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发表于 2017-8-19 09:55 | 显示全部楼层
好好学习一下
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