Illumina测序方法汇总

青草

在高通量测序中，Illumina的测序仪一直是重要的工具。然而，人们渐渐发现，标准的操作步骤已不能满足他们的特定需求。于是，研究人员不断开发出新的NGS样品制备方法，以解决新的挑战。不过，这些方法如此之多，名字又有些相似，让人很难记住。下次想起再去找的时候，又无从下手了

为此，Illumina编辑了一份小册子，收录了近年来发表的各种Illumina测序应用。这份名为《测序方法回顾》（Sequencing Methods review）的小册子覆盖了Illumina边合成边测序技术能解决的各种问题。它以免费的PDF格式提供，简要介绍了每种方法，当然，这些方法是由用户开发的，因此读者需要参考原始文献，才能了解详细的介绍和操作。
以下就是小册子中列出的测序应用
• RNA转录
• RNA结
• 低水平RNA检测
• 低水平DNA检
• DNA甲基化
• DNA-蛋白质相互作
• 序列重排
对于这些目录中的每种Illumina测序分析，该文档列出了文库制备方法，所使用的Illumina技术，优点与缺点，简短总结及相关文献。这也不是Illumina第一次整理这些。之前Illumina还设计了一份类似的海报，内容很好，图形并茂，但不适合在电脑上看。如果有一张，贴在墙上，倒是个不错的选择

举个例子，小册子中介绍了哈佛大学谢晓亮教授开发的MALBAC技术。这种技术克服了MDA（多重置换扩增）的缺点，适用于单细胞测序或起始材料极其有限的样品测序。整个扩增子成环防止DNA多次拷贝，减少PCR偏向。这种技术能扩增富含GC的区域，实现均匀的基因组覆盖。不过，与Phi 29相比，聚合酶容易产生错误，且操作对温度敏感。
对于大家常用的BS-Seq、ChIP-Seq、RIP-Seq方法，小册子中都有详细介绍。如果不幸没有你想要了解的方法，可以联系Illumina。这份小册子应该也有印刷版，可以向Illumina索取。

之前，Illumina也发布了各个应用的论文回顾，包括肿瘤学、传染病、宏基因组学等等，有中文版和英文版。有兴趣的同学也可向Illumina索取。希望这些方法能激励大家开发出新的方法哦。小编只能帮你到这里了。



来源：生物通
百度云附件：sequencing-methods-review.pdf   
(8.75M)

灵响

谢谢楼主的分享

kinghaobin

谢谢分享，学习之

Nothing

好好学习一下

wurencunza

谢谢楼主的分享