典型的HCR过程中,引发剂触发两种DNA发夹之间的级联杂交事件。设计发夹型探针H1和H2,H1包括1´,2´,3和2四个部分,其中2和2´有18对碱基互补成双链作为H1的茎部,3为发夹结构的环部,1´为在发夹结构茎部延伸出的单链粘性末端。H2包括3´,2´,1和2四个部分。其设计和H1相似,1,2,3可分别与1´,2´,3´互补。当没有引发链12存在时,虽然H1和H2中有部分链可以互补,但由于H1和H2分别形成茎环,二者在溶液中均能稳定存在,不会相互杂交而彼此打开。当加入引发链12时,12首先与H1茎部的粘性末端1´2´互补,使H1的茎环结构打开,暴露出32单链,打开H2的发夹结构,接着暴露出于与H1互补的12,可以继续打开H1,依次循环往复,形成由H1和H2交替杂交形成的长链带缺口的双链DNA聚合物。
图片来自知乎:池塘春草梦 不同循环荧光染色技术平台的差别在于:
Foresight 先见一轮最多可以染9个靶标。新高度! HCR是具有一个尾巴的tHCR,因此产物可以通过引入洗脱链,发生支点介导的链置换反应,将产物去组装。整个过程中的孵育与清洗条件都很温和,组织不会脱落,因此,理论上可以实现无限轮次的循环。反复洗脱不影响后续的成像, Akoya是一轮三个靶标。 TSA (Tyramide dignal amplification,酪氨酸信号放大) :一次一种荧光染料标记一种蛋白,在一张切片上最多成像靶标少于10。 图片来自公众号【循因缉药】 为什么采用HCR技术可以放大?放大带来的好处是什么? HCR是杂交链式反应,在目标分子存在下,引发DNA发夹交替开环自组装,形成包含大量重复单元的切口双链DNA结构 计算机辅助设计CAD-HCR,最多可以做到多少HCR引物? 通过CAD设计了HCR序列库,最大的通量在103套,目前已经验证了30套高度正交的序列。 目前验证过的抗体数量和种类? 目前,验证抗体超过100种,能够在高特异性、高灵敏的多重分析中实现平衡。 自标记抗体要求:抗体浓度≥1 mg/mL,BSA and azide Free,单次偶联不低于40μg。 目前先见的业务形态?
|