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[分享] IVD知识文库系列-11.12微生物检测の呼吸道病毒

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发表于 2018-3-30 18:51 | 显示全部楼层 |阅读模式

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编者按:
本次章节新增篇章,为呼吸道病毒篇章。
包含了:呼吸道病毒相关的知识点。
关键词:呼吸道病毒。
其意义在于概括了解呼吸道病毒及市场。
呼吸道病毒是什么?
呼吸道病毒
一大类能侵犯呼吸道引起呼吸道局部病变或仅以呼吸道为入侵门户,主要引起呼吸道外组织器官病变的病毒。
据统计,90%以上的急性呼吸道感染由该类病毒引起。
呼吸道感染是儿童感染性疾病中最常见的疾病,其中90%由病毒引起,近年来不断报道有新的病毒出现,如人类偏肺病毒、博卡病毒和H1N1甲型流感病毒等,单最常见的呼吸道病毒仍主要为:呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、甲型流感病毒(FLuA)、乙型流感病毒(FLuB)、副流感病毒(PIV1、PIV2、PIV3和PIV4)冠状病毒(OC43和229E)和鼻病毒(HRV)等.
1.正黏病毒:
一些具有包膜、分节段RNA,并对人或部分动物红细胞表面的黏蛋白有亲和性的病毒 ,是流行性感冒病毒一个种
流感病毒属于RNA病毒的正黏病毒科,分甲、乙、丙3个型。其中甲型流感病毒为常见流感病毒。
甲型流感病毒最容易发生变异,甲型流感病毒的亚型则被人们称为“禽流感”。
乙型流感,是由乙(B)型流感病毒引起的流行性感冒,其特点是起病急骤,畏寒、发热,体温在数小时至24小时内**高峰,39-40℃甚至更高。伴头痛,全身酸痛,乏力,食欲减退。呼吸道症状较轻,咽干喉痛,干咳,可有腹泻。颜面潮红,眼结膜外眦充血,咽部充血,软腭上有滤泡。可用奥司他韦、利巴韦林等药物治疗,也可用中药治疗。
流感病毒的分型
据NP、M1和M2蛋白抗原性分:甲、乙、丙三型
甲型根据HA和NA抗原性不同,再区分为若干亚型(H1~H16、N1~N9)
乙型、丙型至今未发现亚型
命名规则:
型别
宿主
分离地点
病毒株序号
分离年代(HA与NA亚型号)
(A/HongKong/1/68(H3N2))
2.副粘病毒
核酸为一条完整地单负链RNA,不分节段 。核衣壳呈螺旋对称 •包膜刺突蛋白不同(血凝素、神经氨酸酶、引起细胞融合的融合蛋白、溶血素)。
副流感病毒是副粘病毒科的,它是RNA病毒。它可以分为1 — 4型,它4种亚型各有不同的临床和流行病学特征,像1型和2型的副流感病毒是婴幼儿急性喉气管支气管炎的主要的病毒病原,那么2型和2型的这个副流感病毒与1型和3型相比,在儿童中较少引起下呼吸道感染。
3型副流感病毒是导至婴幼儿肺炎和毛细支气管炎的主要的病毒病原,比较常见,它的流行季节是夏季。另外4型目前最近也是引起比较多的重视,它可以引起上呼吸道、下呼吸道感染。
麻疹病毒是麻疹的病原体,儿童最为常见的急性传染病,冬春季好发,发病率几乎达100%。只有一个血清型,人为唯一自然宿主。
腮腺炎病毒其特点是:流行性腮腺炎的病原体,只有一个血清型,人是其唯一宿主 。通过飞沫或直接接触传播 。学龄儿童为易感人群。
呼吸道合胞病毒是一种RNA病毒,属副粘液病毒科。该病经空气飞沫和密切接触传播。多见于新生儿和6 个月以内的婴儿。潜伏期3~7日。婴幼儿症状较重,可有高热、鼻炎、咽炎及喉炎,以后表现为细支气管炎及肺炎。少数病儿可并发中耳炎、胸膜炎及心肌炎等。
成人和年长儿童感染后,主要表现为上呼吸道感染。确诊可分离病毒及做血清补体结合试验和中和试验。应用免疫荧光技术检查鼻咽分泌物中病毒抗原,可作快速诊断。治疗以支持和对症疗法为主,有继发细菌感染时,可用抗菌药治疗。预防同其他病毒性呼吸道感染。
3.披膜病毒
其中许多成员过去被称为"虫媒病毒",在病毒核壳外面披盖着一层保护其活性的蛋白包膜的一类病毒。其中甲病毒类可引起人、马脑炎;黄病毒类可引起人黄热病、登革热病、绵羊跳跃病;风疹病毒可引起风疹。
风疹病毒是引起风疹的主要病原体,母婴传播感染是其造成的最严重的问题,在优生优育中有重大意义。
4.小RNA病毒
RNA病毒中最小的类群。包括:肠道病毒属。因能感染人、牛、猪等肠道得名。
鼻病毒其特点是 单正链RNA病毒,核衣壳二十面体对称,无包膜,是普通感冒和上呼吸道感染最重要的病原体,具有自限性。
5.冠状病毒
冠状病毒是引起人类普通感冒的最重要病原体之一,也可引起婴儿腹泻,2003年3月鉴定的人冠状病毒SARS-CoV,是引起严重急性呼吸综合症世界流行的病原体。
6.腺病毒
腺病毒其特点是传播途径:胃肠道、呼吸道、密切接触。急性咽炎、流行性角膜结膜炎、病毒性肺炎、胃肠炎与腹泻。
7.其他病毒
呼肠病毒其特点是节段性双链RNA病毒,双层蛋白衣壳,核衣壳二十面体对称形,无包膜,主要引起轻度上呼吸道感染和胃肠感染。
人偏肺病毒属于副粘液病毒科,是RNA病毒。人偏肺病毒是2001年新发现的,它感染症状与合胞病毒相似,至少在人类传播了50年。偏肺病毒是引起儿童急性下呼吸道感染的重要病毒病原,仅次于合胞病毒。偏肺病毒是继RSV之后引起婴幼儿毛细支气管炎的第二位的重要的病原。它还可诱发哮喘。它在温带的流行季节一般是冬季和早春。流行高峰一般出现在RSV和流感病毒之后,副流感病毒之前。
博卡病毒是细小病毒科细小病毒亚科的一个属,是DNA病毒。与人类急性呼吸道感染密切相关,病征与普通感冒相似,澳大利亚和中国等地都发现相同病毒,感染率大于5.6%。
小儿呼吸道感染是什么颜值的?
急性呼吸道感染(ARTIs):是小儿最常见的疾病,居门诊就诊数、住院数和病死数的首位。
急性上呼吸道感染(URTIs):包括了以急性鼻咽炎为主的普通感冒、急性鼻窦炎、中耳炎、扁桃体咽炎、喉炎、会厌炎等 ,病原学因感染部位不同---有同有异。
急性下呼吸道感染(LRTIs):是指气管、支气管、细支气管和肺组织(包括肺泡和肺间质)等部位的炎症。
病毒病原是在婴幼儿CAP初始阶段十分重要,单纯病毒感染约占小儿CAP的14~35%。
常见病毒:RSV、PIF、IF、ADV、鼻病毒、呼肠病毒。
细菌病原是在发展中国家仍为小儿CAP重要病原,但培养阳性率仅5~15%。
肺炎支原体是重要性在增加,但季节、流行年份的影响很大,占病原10~30%以上;
衣原体、沙眼衣原体以6个月内,尤其3个月内婴儿多见,肺炎衣原体5岁以上多见,约占病原0~15% 。
混合感染 占8~40%,年龄越小混合感染的机率越高。
小儿流感的特点
小儿呼吸道疾病诊断流程
小儿呼吸道病毒治疗共识
小儿用药指导
呼吸道疾病:极光计划儿童专家组
“极光计划”是响应国家关于“深化医药卫生体制改革”以及“全面提升县级公立医院综合能力”总体要求而生的一个医疗服务能力提升计划,或可助力全面推进分级诊疗制度建设。第一阶段将有1000家县级医院和30000名县级医院医生受益。
第一阶段(2015——2017年)将首先在湖南、湖北、河南、河北、安徽、四川、重庆7个省市启动试点工作,培训目标包括培训至少1000家县级医院管理人员,进修至少1000名县级医院骨干医生,以及培训至少30,000名县级医院医生。
该阶段将由全国专家工作组按照县级医院的诊疗服务功能定位设计培训内容,以各省三级甲等医院为县级医院帮扶示范基地,综合“派下去、请上来、团队带团队”等多种形式具体开展培训工作,使县级医院能够切实满足“县域内常见病、多发病诊疗”的需求。
第二阶段(2018——2020年),项目将在全国范围推广。国家卫计委医院管理研究所对外合作部副主任朱微微表示,每年将调研跟踪项目进展,实时了解县级医院需求变化,调整项目工作方向。
“极光计划”得到了各领域学科带头人的支持。北京大学第一医院霍勇教授、中日友好医院王辰院士、北京儿童医院申昆玲教授以及中国工程院樊代明院士将分别牵头相关专业专家共同设计、编写适合于县级医院的培训教材,从学术、技术层面指导各省深入帮扶县级医院。
常见呼吸道病毒检测方法
(一)一般实验室检查
外周血常规:白细胞总数一般不高或降低。
血生化:部分病例出现低钾血症,少数病例肌酸激酶、天门冬氨酸氨基转移酶、丙氨酸氨基转移酶、乳酸脱氢酶、肌酐等升高。
(二)病原学相关检查
病毒核酸检测:
以RT-PCR(最好采用real-time RT-PCR)法检测呼吸道标本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽或气管抽取物、痰)中的流感病毒核酸。病毒核酸检测的特异性和敏感性最好,且能快速区分病毒类型和亚型,一般能在4-6小时内获得结果。
病毒分离培养:
从呼吸道标本中分离出流感病毒。在流感流行季节,流感样病例快速抗原诊断和免疫荧光法检测阴性的患者建议也作病毒分离。
病毒抗原检测(快速诊断试剂检测):
快速抗原检测方法可采用免疫荧光的方法,检测呼吸道标本(咽拭子、鼻拭子、鼻咽或气管抽取物中的粘膜上皮细胞),使用单克隆抗体来区分甲、乙型流感,一般可在数小时以内获得结果。
血清学诊断:
检测流感病毒特异性IgM和IgG抗体水平。动态检测的IgG抗体水平恢复期比急性期有4倍或以上升高有回顾性诊断意义。
一、 病毒的分离培养
重症流感判断标准
流感病例出现下列1项或1项以上情况者为重症流感病例
(一)神志改变:反应迟钝、嗜睡、躁动、惊厥等。
(二)呼吸困难和/或呼吸频率加快:成人及5岁以上儿童>30次/min;1岁-5岁>40次/min;2月龄-12月龄>50次/min;新生儿-2月龄>60次/min。
(三)严重呕吐、腹泻,出现脱水表现。
(四)少尿:成人尿量<400ml/24hr;小儿尿量<0.8 ml/kg/h,或每日尿量婴幼儿<200ml/m2,学龄前儿<300ml/m2,学龄儿<400ml/m2,14岁以上儿童<17ml/h;或出现急性肾功能衰竭。
(五)动脉血压<90/60 mmHg。
(六)动脉血氧分压(PaO2)<60mmHg(1 mmHg=0.133 kPa)或氧合指数(PaO2/ FiO2)<300。
(七)胸片显示双侧或多肺叶浸润影,或入院48小时内肺部浸润影扩大≥50%。
(八)肌酸激酶(CK)、肌酸激酶同工酶(CK-MB)等酶水平迅速增高。
(九)原有基础疾病明显加重,出现脏器功能不全或衰竭。
呼吸道病毒检测方法学对比及注意事项
机体产生IgM一般需要一周左右的时间,而有免疫缺陷或免疫系统不健全的个体如儿童,特别是3岁以下的小孩,其产生抗体往往需要更久,且抗体产生的水平也较低。
若检测的是IgG,则不能很好地区分既往感染和急性感染。
因此,抗原检测的方法对婴幼儿和儿童的呼吸道感染的病因诊断、鉴别诊断和临床用药指导比抗体法更有优势检测抗体IgM比IgG更有临床意义。










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