如何高效选择实验用蛋白和抑制剂？

会里很

如何高效选择实验用蛋白和抑制剂？
原文地址：https://www.zhihu.com/question/605085154

长长的路

选择实验用蛋白：
1.纯度高：实验用蛋白的纯度应该很高，以确保实验结果的准确性和可重复性。
2.结构稳定：结构稳定的蛋白质有助于实验的稳定性和准确性，同时也可以减少误差。
3.合适的浓度：浓度过高或过低的蛋白质会影响实验的准确性和可重复性。
4.合适的来源：实验用蛋白的来源应该可靠，最好是从商业供应商购买，以确保质量和稳定性。
选择抑制剂：
1.选择适合的抑制剂类型：在选择抑制剂前，需要了解待抑制的分子机制和生物学特性，以确保选用的抑制剂是适合的。
2.浓度适当：抑制剂的浓度应该适当，过高或过低会影响实验结果。
3.鉴定纯度：抑制剂的纯度应该高，以确保实验结果的准确性和可重复性。
4.来源可靠：抑制剂的来源应该是可靠的，最好是从商业供应商购买。
5.无毒副作用：选择的抑制剂应该是可溶的，对待测生物无毒副作用，并且不影响化学反应进行。

同花顺

萌 CC：嗨，趴 MCE 官网一早上了，在干什么？  
科研小白：新课题确定了，导师想要我研究 XXX 关于 XXX 的疾病的研究，在选产品呢，蛋白，抑制剂，一一搜索 ing…  
萌 CC：你是怎么选的？
科研小白：比如 EGFR, 在官网搜索框点击 EGFR, 进入靶点, 勾选类别,选择排名在前的产品仔细研究。  




萌 CC：方法是个好方法，还有更便捷的方式 -- 基因作用数据库。
科研小白：？？？这是个什么数据库~
萌 CC：这个数据库基于海量热门基因，整合了来自 HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee)，NCBI (national center for biotechnology information)，Ensembl (Ensembl genome browser 107），OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man)，和 Gene Cards 等各大权威数据中心，混合与多类型数据库的交互方式。同时，数据库也配套提供了关联疾病及化合物库。 下面一起看看具体功能吧！
1. 基因作用数据库基本功能

1.1 Quick Search 功能

通过 Search 基因名或基因符号，就可以看到该基因在不同物种下的所有名目。还是以 EGFR 为例，检索后可以一览该基因所属的信号通路、同源信息，以及组织表达情况。  


1.2 Flexible Browse 功能

点击特定基因，进入到详情页面。各个模块集中展示了研究工作中重点关注信息。可以根据基因-蛋白-疾病-产品的顺序，或点击上方的浮动工具栏，按需获取基础信息。  


例如蛋白模块，下方列出了多种蛋白名称用法，来源于已有研究/出版刊物的使用记录。高频率名称将推荐为主名。  


2. 信息筛选

科研小白：是很方便，但我还有个疑问，比如我就想选择一个 EGFR 重组蛋白，下面列出这么多，我该怎么判断？
萌CC：下方列出的重组蛋白可用直接从名称上知悉一二。 例如红色框的内容表明它是重组 EGFR 蛋白，绿色框表明来源物种，蓝色框则说明了蛋白长度、表达体系、融合标签、以及是否生物素化。“蛋白编号” 列关联了 Uniprot 这个蛋白资源宝库，有更多好奇心的童鞋可以再探索更多信息~  


Tips： (1) 蛋白长度或决定蛋白功能是否正常。 (2) 常见的表达体系有 E.coli、CHO、Sf9、赤毕酵母等。 E.coli 适用于原核来源或无需翻译后修饰的真核蛋白。CHO 是哺乳动物细胞，具有表达稳定、蛋白修饰准确的优点。Sf9 昆虫细胞则是杆状病毒常用的表达宿主。赤毕酵母是甲醇营养酵母，可提取高纯度重组蛋白。最后，应根据具体情况选择合适的表达系统。 (3) 融合标签是免疫分析的重要帮手，一般可增强蛋白可溶性、屏蔽毒性蛋白。应选择大小合适的标签用于后续实验。 (4) 生物素化不干扰分子固有功能，可特异性结合链霉亲和素或抗生物素蛋白，增加实验设定。
3. 关联疾病

科研小白：明白了。接下来的疾病模块好长呀，我大概知道 EGFR 与多种疾病有关系就好啦，没想到 MCE 基因作用数据库要给我看这么多。
萌CC：是的，这里展示的基因关联疾病数目确实很多。但是检索方式灵活，支持识别疾病主名/别名。比如你想了解癌症领域的疾病，在检索框搜索 “Cancer”，结果里出现的癌症疾病在一定程度上可以帮助课题细分方向，选择合适的动物模型研究。包含丰富别名的疾病，更是有潜力的应用方向哦，论文创新点+1+1。


4. 如何选取相应产品？

科研小白：听起来好像有了些课题灵感。那么小分子抑制剂呢？人源鼠源都是EGFR，下面这些都是有用的产品？  
萌CC：一般情况下，小分子药物不区分种属 (但是也要多看文献!) 下面的 “关联产品” 模块按临床阶段分类，并进一步细分为生物活性分子及抗体抑制剂 (需要注意种属)。
1. 示例产品与 MCE 的产品目录直接交互，点击 可以跳转产品详情页，了解试剂的更多生物信息。详情页还提供有体内外的实验示例哦，附有实验条件和设定结果，小白你就不用为新产品入手太发愁了。  


  2. MCE 基因作用数据库套用了 MedChemExpress (MCE) 专有罕见病产品库，帮助你进一步选取研究重心、开拓课题版图。  


3. 对于临床中的产品，还详尽展示了对应的具体临床阶段  


MCE 基因作用数据库还在进一步开发新功能、新模块。包括表达直方图，完善基因表达图谱，展示直观具体的表达模型。以及构建基因互作和 GO 分析网络，致力于网罗上下游关键基因，阐明通路机制。MCE 基因作用数据库帮助用户快捷获取基因生物信息，发现潜在的生物学效应，为您的科研保驾护航。