测序仪的风口又来了

大v

大家想必在周五都被雷击了一遍，好在天无绝人之路。
这不，咱们测序仪的风口...又来了！



2024年1月24日，英国健康安全局（UK Health Security Agency, UKHSA）发布了一份文件，题为《UKHSA 病原体基因组战略》。
在认识到病原基因组对健康领域特别是疫情防控领域的巨大贡献之后，UKHSA提出了这一横跨5年的策略构想，值得我们研读研读。

  整体战略目标  



UKHSA发布的这份战略的目的是通过形成一个单一的合作项目，将NHS、科研伙伴、工业界和其他政府部门进行整合，最大化病原基因组研究在公共健康威胁防护方面的效能。
该战略的终极目的是将病原基因组检测应用于日常公共卫生决策，强化基于证据的策略制定方式。
该策略将改善公共卫生安全、检测和隔离疫情、推动疫苗和治疗方法研究，能够让英国有能力检测新的病原体和威胁。


而这一切最关键的技术就是测序技术！
UKHSA提出，利用现有基础设施和科学技术水平，勾画出一个病原基因组的5年愿景。
本战略提出7大目标，3个优先事项来支撑这个愿景，接下来我们将逐一为大家介绍。

  7大目标3个优先  



目标1：利用基因组数据优化从地方到全球的公共健康决策
切分为3个子目标，分别是：
A）将病原体基因组数据整合进公共卫生体系；
B）开发病原体基因组数据使用的最佳使用实践指南；
C）评估并应用宏基因组分析。



目标2：使用基因组学数据驱动诊断、疫苗和治疗方式的改善。
包括两个子目标：
A）使用病原基因组数据反哺疫苗开发，即旧疫苗是否有用，新疫苗如何开发。
B）使用病原基因组数据加强新疗法的开发和部署，即更好的监控耐药性等。



目标3：提供国家级高通量病原基因组测序与分析服务协调机制。
包括3个子目标：
A）确保有足够的基础设施和合作伙伴来对病原基因组进行测序并分析进而支撑决策制定。
B）促进病原基因组系统的韧性和适应性，也就是说弹性可扩展。
C）确保全国范围内的公平可及性。



目标4：在UKHSA内部和外部进行基因组人才转型。
包含2个子目标：
A）加强临床和科研基因组学专业知识和培训。
B）提高临床和公共卫生领域的基因组学素养。



目标5：承诺病原基因组数据的共享和全球合作。
也包含2个子目标：
A）允许快速的公共数据共享。
B）促进写作网络的建立。



目标6：驱动病原基因组创新。
包含三个子目标：
A）在病原基因组领域设定健康防护和安全研究开发的优先事项。
B）开辟创新中枢，即链接产、政、研三端的机构。
C）开发产业合作伙伴，包括测序技术、生信工具、诊断平台等。



目标7：建构一个高性价比的服务系统。
分为2个子目标：
A）开展严谨的经济学评估。
B）确保长期可持续。



那么3个优先领域是什么呢？
首当其冲的是抗生素耐药问题（Antimicrobial resistance，AMR）。
通过使用病原基因组学技术能为耐药机制和传播模式提供详细的信息，使医疗从业者和政策制定者能够实施真毒性的感染控制干预和开抗生素药物管理计划，最终保护抗生素的有效性。
其次，新传染病和生物安全问题。
病原体基因组学将作为新兴感染的早期预警系统，有助于检测、快速和精确鉴定新型或变异病原体。这一能力将指导及时的公共卫生响应，加强生物安全，并减轻全球健康威胁的影响。
第三，可预防疾病和消除计划。
将病原体基因组学应用于可预防疾病的疫苗开发和应用，将为疫苗的研发和应用提供信息，支持疾病传播链的识别和切断，并在消除可免疫疾病目标中发挥作用，从而最终提高疫苗的效力和增强人群免疫力。

  测序仪大单  

按照目前的5年计划，基本上确认了测序仪在该战略上的关键作用。
那么，首先能够沾光的当然是Oxford Nanopore了。



看看今年ONT（Oxford Nanopore Technology）在JPM 2024上的介绍，那就妥妥的是弹性可扩展平台的典范啊。
另外，从中低通量到超高通量的测序仪系统，中美两大巨头都是产品线齐全且在COVID-19防控中证明了自己。
只要不打政治牌，MGI和Illumina相信都有机会。
至少，这是个增量项目。
也说明了测序仪在未来疾控领域不可或缺的地位，2024年测序仪还是有希望嘛。

来源：循因辑药

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