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超高灵敏度AML NGS MRD监测产品重磅发布!

2025-7-22 16:30| 编辑: 归去来兮| 查看: 259| 评论: 0|来源: Kingmed Hematology

摘要: 极大满足临床对于高灵敏MRD监测的需求。

多年来,AML患者的MRD监测难题一直困扰着医学界,现有方法往往存在灵敏度较低(流式细胞学)、适用范围窄(Q-PCR)、对实验室检测能力要求高(dd-PCR)等方面问题,难以完全满足临床需求。针对这一困境,金域医学凭借多年技术累积和方法升级,利用NGS方法针对FLT3-ITD和NPM1突变热点区域进行扩增和高深度测序,使得以上两种AML热点变异检测灵敏度高达10-5-10-6,极大满足临床对于高灵敏MRD监测的需求。


可监测的残留病(Measurable residual disease, MRD),指通过体外各种方法学能监测到的肿瘤细胞相关的标志物,是代表体内肿瘤细胞残留水平的重要指标。MRD在急性髓系白血病(AML)等血液肿瘤中,具有重要的临床指导意义:可作为复发风险预测的生物标志物,用于精准预后风险评估和为治疗决策提供重要的信息。


流式细胞术由于快速、准确的特点,是临床最常用的MRD监测手段,可以覆盖90-95%的AML患者人群。但是由于技术局限性,其灵敏度仅有约10-3-10-4。另外,基于DFN(different  from normal)的流式MRD,某些因素(比如G-CSF等的使用、抗原漂移等)可能会带来假阳性的干扰。因此,单纯的流式MRD监测技术难以满足临床需求。


分子生物学方法为基础的MRD监测技术可对流式MRD进行很好的补充。其中qPCR方法可以对约40%融合基因驱动的AML患者进行以融合基因为基础的MRD监测,其灵敏度可高达10-4-10-5。接近50-60%的AML可检测到基因突变,最新版2022 ELN指南建议可以利用PCR或者NGS方法学动态监测相关基因突变负荷综合进行预后评估。如下图所示,AML中突变发生率最高的FLT3和NPM1基因突变,是最新版2022 ELN指南和最新研究中建议用于MRD监测的重要分子生物学标志物。同时,高灵敏的FLT3和NPM1 MRD监测具有重要的临床指导意义。

 AML中推荐的用于MRD监测的分子标志物及其发生率 [1]



精准预后评估

Sun Loo 和Laura W Dillon等人在分别在2022年Blood和2024年JAMA Oncology上发表研究表明,AML患者在CR1期移植前的FLT3-ITD的高灵敏度MRD监测结果可以提示移植后复发和死亡风险。当FLT3-ITD VAF值>0.001%(即1x10-5)时,其复发和死亡风险高于MRD阴性(VAF<0.001%,即1x10-5)患者人群。同样的Mark J Levis等人在2025年Blood上发表的III期临床试验(Blood and Marrow Transplant Clinical Trials Network,  1506 "MORPHO")研究中给出了相同似的结论,同时强调了不论是移植前还是移植后,ITD MRD阳性(VAF>0.0001%,即1x10-6)均可以提示预后结局不佳。以上研究表明,高灵敏(低至10-5-10-6)的ITD MRD在精准的预后风险评估中发挥着重要的作用。[2-5]

移植前 ITD  VAF<0.001%提示OS预后良好[3]


移植前ITD  VAF<0.001%提示复发风险降低[3]


移植前ITD  VAF<0.001%提示复发风险降低和OS延长[4]


移植前/后任意时间点ITD VAF<0.0001%(小于MRD6和MRD0)提示预后良好[5]


靶向用药指导方案调整

上述III期BMT CTN 1506临床研究结果显示MRD检测可以有效识别出最有可能从吉瑞替尼治疗中受益的患者,即存在MRD阳性(ITD>0.0001%,即MRD6及以上)的患者。对于这些患者,建议尽早开始吉瑞替尼治疗,并尽量减少治疗中断。对于MRD阴性(MRD 0)的患者,可以考虑停止吉瑞替尼治疗,但需密切监测MRD。以上结论支持将FLT3-ITD MRD检测纳入标准治疗实践,通过MRD检测,可以更精准地为患者提供治疗,减少不必要的治疗和副作用,并为吉瑞替尼在HCT后的维持治疗提供了进一步的证据。[5]


精准克隆演变检测

基于NGS方法学的ITD MRD检测技术可以明确每个克隆的序列,对于毛细管电泳鉴定出的相同片段长度的不同ITD克隆可以进行精准区分。其动态监测变化能更好的追踪克隆演变过程,并在早期提示疾病复发可能。[5-6]

不同时间点ITD克隆变化情况[5]


罕见亚型监测和不同方法学之间补充验证

目前用于NPM1突变监测的方法有qPCR和ddPCR,检测样本类型有DNA和cDNA,但是以上两种方法学只能对常见的ABD 亚型的NPM1突变进行定量,罕见的亚型需要单独开发PCR体系,定制特定的PCR探针进行突变定量监测。基于NGS方法学的NPM1 MRD监测体系是对NPM1(NM_002520) exon11进行扩增,可以监测发生在exon11上任意一种非A、B、D亚型定量变化。如下图所示为NPM1(NM_002520) exon11 处的突变类型,其中A型突变约占75-80%,B 型突变约占10%,D型突变约占5% 其他罕见类型突变约占5%。[7]

NPM1(NM_002520) exon11 处的突变类型[7]


由于每种方法学和实验体系均具有一定的方法学偏倚,不管使用哪种检测方法,当样本中肿瘤细胞含量极低,NPM1突变水平接近特定方法学检测下限时,都可能会出现假阳性或者假阴性等多种方法学不一致的情况,影响临床决策判断。因此临床需要更多的高灵敏NPM1 MRD监测方法,能在不同结果出现矛盾时提供结果参考,更好的辅助临床进行决策判断和治疗方案调整。


金域医学推出基于NGS的FLT3-ITD和NPM1 MRD检测


利用多年的技术累积和研发创新,金域医学推出了基于NGS的LT3-ITD和NPM1 MRD检测。该检测具有以下特点:

1

超高灵敏度

通过扩增子技术,将FLT3-ITD(exon14-15)和NPM1(exon11)热点区域进行扩增,后经过高通量测序测序和生物信息分析,最后得到高灵敏的FLT3-ITD和NPM1突变定量的MRD结果。

针对FLT3-ITD,当ITD突变频率在10-5水平以上时,检出率为100%;10-6水平以上时,检出率为93%。而针对NPM1,当突变频率在10-4水平以上时,检出率为100%;10-5水平以上时,检出率为95.6%。相较于传统流式技术,有效将检测灵敏度提升10-100倍。

2

多种产品组合

对于初诊仅有FLT3-ITD或者NPM1阳性患者,可以送检单独的FLT-ITD或者NPM1 突变的MRD监测;对于初诊同时有FLT3-ITD和NPM1突变的患者可以送检包含两种变异的性价比极高MRD检测panel 组合。

3

动态曲线展示

以表格和曲线的形式,展现患者MRD动态变化趋势。

该结果提示:患者在治疗后第二次监测时,尽管初诊的两个ITD克隆和NPM1克隆呈现下降趋势,但是新出现一个100bp ITD克隆,具有极强的复发风险。



校对:张隽姝

审核:周剑峰


参考文献

1. Hematology Am Soc Hematol Educ Program. 2022 Dec 9;2022(1):9-14.

2. Blood Adv. 2018 Apr 24;2(8):825-831.

3. Blood. 2022 Dec 1;140(22):2407-2411.

4. JAMA Oncol. 2024 Aug 1;10(8):1104-1110.

5. Blood. 2025 May 8;145(19):2138-2148.

6. Blood. 2021 Jun 3;137(22):3093-3104.

7. Blood. 2007 Feb 1;109(3):874-85.


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