大全 | mNGS与tNGS共识全到碗里来~

2025-6-21 19:30| 编辑: 小桔灯网| 查看: 104| 评论: 0|来源: 菌小姐

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Hello, All Pathogens!

新说| 人体微生物

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mNGS发展近10年，tNGS发展近5年，随着临床应用，对应的共识逐步从无到有，呈现百花齐放的态势。本篇集锦按照时间顺序整理了mNGS与tNGS应用以来的所有共识，并简要速读指出重点，读者感兴趣可自取。

mNGS共识集锦分为两个部分，第一部分是全篇聚焦于mNGS技术的共识，第二部分是撰写针对某个病原、某种疾病共识时简要提及，推荐mNGS作为一种检测方法在特定场景使用。

一、mNGS共识（第一部分）

1.宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识（2019）

速读：首篇关于mNGS的系统性共识，肯定了mNGS在急危重症感染患者中的价值，从适应证患者选择到mNGS的全流程进行撰文，并提出未来发展方向。

2.宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床应用专家共识（第一版）（2020.5）

速读：偏技术维度，重点关注mNGS技术的检测与质控以及报告解读规则，从设施设备、检测、判读控制、数据库建设等方面提出质控要求，阴阳性结果的解读以及分病原体类别提出报告阈值。

3.中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识（2020.11 ）

速读：从临床维度分证据等级推荐，包括mNGS在中枢神经系统感染、血流感染、局灶性感染、呼吸道感染中的适用范围，同时涵盖mNGS样本采集到检测结果判读的关键意见和各症候群或特殊病原体如结核分枝杆菌的诊断效能评价。

4.高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化专家共识（2020.12）

速读：检验维度细化各样本类型采集规范与转运，提出mNGS技术实验室建设要求、对应的检测平台要求，从前处理开始到检验报告全流程的方法学建立要求，以及分析性能与临床性能确认的关键要求。同时提出分析前、中、后如何进行质量保证。

5.宏基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中国专家共识（2021.2）

速读：基于多轮专家投票确认共识建议推荐或考虑。首先对mNGS进行分类以及对应术语规范。细化适应证，如涵盖临床适应证、微生物学适应证、耐药学适应证等，并提出mNGS各步骤中的管理要求。质量管理保证章节谈及多个因素，如污染、测序深度、数据库等对结果的影响。也包括性能验证和标准化、偏技术维度的报告解读指引。

6.宏基因组测序病原微生物检测生物信息学分析规范化管理专家共识(2021.9)

速读：如题，mNGS生物信息学分析板块共识。首先规范了常使用到的生物信息学名词，介绍了微生物参考基因组数据库、人源参考基因组数据库等多样的公共数据库。其次介绍了比对数据库构建过程以及mNGS生物信息学分析程序。对生物信息学平台与人员提出基本要求。

7.中枢神经系统感染性疾病的脑脊液宏基因组学第二代测序应用专家共识（2021.12）

速读：如题，针对中枢神经系统感染的mNGS共识。涉及此症候群的适应证与送检时机、标本的管理、检测、报告及实验室质控以及阳性与阴性报告解读。特别提及脑脊液mNGS后的临床应对措施。

8.呼吸系统感染中宏基因组测序技术临床应用与结果解读专家共识（2022.4）

速读：如题，针对呼吸系统感染的mNGS共识。偏临床应用，涉及该系统感染的适应证、标本类型选择、结果解读。特别分类列出不同类型标本mNGS检出微生物的临床意义。

9.宏基因组二代测序技术在新生儿感染性疾病中的临床应用专家共识（2022.6）

速读：如题，针对新生儿感染的mNGS共识。偏临床应用，涉及该技术在新生儿群体的送检适应证，并列出指引流程图。涵盖针对该群体的样本采集与转运、报告解读。

10.重症社区获得性肺炎患者支气管肺泡灌洗液的宏基因组测序结果临床判断指导原则（2023.1）

速读：如题，针对重症社区获得性肺炎患者群体，对支气管肺泡灌洗液（BALF）的临床报告进行解读。该共识列举了该类患者群体BALF中mNGS检测常见的微生物（分细菌、病毒、真菌、非典型病原体、寄生虫），并对每种检出的微生物的意义进行简要概述。

11.高通量测序技术在分枝杆菌病诊断中的应用（2023.3）

速读：如题，聚焦于分枝杆菌病诊断专题，提及mNGS与tNGS两种高通量测序技术。涵盖了NGS检测分枝杆菌的适应证与送检时机，标本采集、检测、报告以及实验室质量控制以及临床结果判读。包括分枝杆菌病的耐药诊断内容。

12.下呼吸道感染宏基因组二代测序报告临床解读路径专家共识（2023.4）

速读：如题，重点围绕下呼吸道感染mNGS检测报告的临床解读，以问答形式进行，共17个问题。对比了mNGS与传统微生物方法的优势与不足，并对mNGS结果如何进行临床解读进行了流程梳理。该共识也提及tNGS技术。

13.宏基因组学测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识（2023.5）

速读：如题，重点围绕成人医院获得性肺炎（HAP），特别提及mNGS用于该患者群体耐药和毒力基因检测。以及针对该患者群体的特殊解读意见，比如对污染的考量以及口腔菌群的解读等。

14.宏基因组二代测序技术在血液病患者感染病原诊断中的应用中国专家共识（2023年版）

速读：如题，重点围绕血液病患者。包括了此类患者的适应证，细化了不同样本类型送检采集注意事项，并特别绘制该类患者的 mNGS 送检流程图，还绘制了常见临床样本中 mNGS 检测不同病原体的临床价值判断热图。

15.病原宏基因组高通量测序临床本地化检测规范专家共识（2024）

速读：实验室自建检测（LDT）视角下的 mNGS 本地化指导共识。包含实验室建设基本要求、湿实验流程搭建、干实验流程搭建、性能确认、临床诊断性能评价、质量管理等具体落地要求和建议。

16.病原微生物宏基因组测序生物信息分析及报告质量控制专家共识（2025）

速读：如题，侧重生物信息分析及报告质量控制。共识内容分证据等级和推荐强度。首先规范了生物信息分析过程中的术语定义、涉及 mNGS 的检测数据要求、生物信息分析流程及质量控制要求、数据解读和结果报告要求。特别梳理了生物信息分析结果生成临床报告的流程。

二、mNGS共识（第二部分）

1.中国利什曼原虫感染诊断和治疗专家共识（2017）

2.儿童呼吸道感染微生物检验标本采集、转运与检测建议（病毒篇）（2018）

3.儿童呼吸道感染微生物检验标本采集、转运与检测建议（细菌篇）（2018）

4.中国成人医院获得性肺炎与呼吸机相关性肺炎诊断和治疗指南（2018 年版）

5.终末期肝病合并感染诊治专家共识（2018）

6.中国成人念珠菌病诊断与治疗专家共识（2020）

7.儿童呼吸道感染病原体核酸检测专家共识（2022）

8.颅内曲霉菌病诊治中国专家共识（2023）

9.成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识（2023）

10.鹦鹉热诊疗中国专家共识（2025）

三、tNGS共识

mNGS专项共识中涉及tNGS的有两篇，已在上方描述。tNGS近来发表的专项共识有两篇如下：

1.靶向高通量测序在感染性疾病中应用与实践专家共识（2024）

速读：首篇针对tNGS的共识，首先区分定义了两种tNGS技术路线。从临床适应证、技术要点、干湿实验、报告发放与解读全流程对tNGS技术进行了共识推荐。绘制了tNGS/mNGS选择及tNGS临床解读处置流程。

2.靶向二代测序在感染性疾病诊疗中的规范化应用专家共识（2025）

速读：首先定义了tNGS技术，以表格形式比较了其与mNGS技术的关键参数。详细描述了tNGS的应用场景和优势，同样包含从样本采集规范、实验室检测、临床解读到质量控制的全流程。

不知道看完上述共识索引，您作何感想？笔者真的是感慨万千。mNGS从最开始个别共识简要提及，到现在专项共识已经达到16篇之多，细化的病种、细化的适应证、细化的全流程、多达数百位临床&检验专家参与其中贡献智慧，真的是一件了不起的事情！

详细共识资料包请关注菌小姐，后台回复“共识下载”获取

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（注：图片借鉴网络资料，感谢原图作者！）

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