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赛纳P1000X测序仪“不讲道理”

2025-2-21 16:50| 编辑: 归去来兮| 查看: 182| 评论: 0|来源: 循因缉药

摘要: 赛纳新测序仪发布了,P1000和P1000X。


赛纳新测序仪发布了,P1000和P1000X。

其实很好理解,就是当年的Illumina HiSeq X和X Ten的玩法。

发布会大部分人都会看,我这里主要跟大家掰扯掰扯几个感兴趣的点,全网独一份。

声明:本文所使用图片来自厂家PPT,内容来自发布会和我们的推论,如有错误,欢迎指正。


#01

“芯片重置”

测序仪芯片与测序化学、图像获取识别构成了NGS测序仪的核心三要素,也是成本三要素。

其中图像获取识别模块是软硬件构成,基本上是固定投入。

测序芯片(flow cell,FC)和测序化学(试剂)就是我们测序的主要成本。

曾经,非pattern玻璃基芯片其实是不贵的。

然而,为了追求更高的测序质量和芯片密度,现在大家选择的硅基芯片成本还是不便宜的。

这次赛纳发布会上推出了芯片重置功能真的吓到我了,而且可以重置10次...这不讲道理好吗。

在这之前,还没有人这么做过或者做到过。

所以,P1000X能做到50美元30X的人WGS测序我是相信的。

对,P1000暂时没开放哦,毕竟这是另外的价钱。

其实这事2010年就有人开过脑洞,只不过实诚的赛纳人给实现了...还拿出来了...

脑洞人的浪漫...我们不一样...


#02

“我们不一样”


好,我们来看第二个关键的东西:测序化学。

赛纳 P1000采用的测序化学与其桌面型S100的Fluorogenic技术并不相同,被称为LumoSeq技术。

当然,二者也有一些传承。

国产测序仪风云录之赛纳生物


我们此前在上文中有过详细描述Fluorogenic技术和ECC测序,这里节选一点:




1、直接在磷酸基团而不是碱基上进行荧光标记,但是由于跟磷酸基团连接,此时不发光。


2、聚合反应发生时,三磷酸酯与荧光基团脱落并被磷酸酶水解。


3、游离状态荧光基团被激光激发并发光。





这几条二者都是相同的,但是不同的是LumoSeq技术每轮延伸一个碱基直接图像识别。

并没有使用简并碱基测序和ECC纠错编码测序方式。

据说是图像识别技术与荧光强度又有了升级,不需要了。

但是,大家要注意,LumoSeq使用的是单色荧光,又是如何分辨四种碱基的呢?

一个可能的方式是通过4种碱基的荧光强度分级做到的,这点并没有资料支撑。

不然,不可能对吧?这不讲道理啊...

欢迎厂家解惑。


#03

“花活与花火”


P1000/X其实有不少“花活”,比如双芯片滚动上机、多点输出(意味着可以先出一份“报告草稿”)、现有文库的无缝衔接。

而这些“花活”赛纳都没多讲...好像很平常...

这没道理...直到我看到这张图。


自定义文库结构、自定义芯片表面引物...这是要干啥...

我瞬间能想到的就是,这货完全可以做空转啊...

自定义测序引物和读出模式:那我R1测19,R2测199也可以?甭管为什么,我就是这么任性,你就说可以不可以?

可以!!!!!!

这个被称为“OpenSeq开测”的计划,不仅仅是要送大家测100万Gb免费数据,还要激发出应用的花火、在市场上掀起应用开发的浪潮啊。

高,实在是高。


#04

最后


真的很开心,现在国内测序仪有这么多新的玩家。

因此,Illumina被送上《不可靠实体清单》其实大家一点都不担心。

信心,还是要有的。

更重要的是,我们的华大智造、真迈、赛陆和塞纳们,各有各的“花活”。

而这,也必将让行业诞生更多应用的“花火”。

哦对了,这货有两种规格芯片PT1(现货)、PT2(期货,2025Q4)。

二者就能够在PE150的规格下输出Q40>=85%的数据,运行时间36小时。

最后,LumoSeq大家是不是有点耳熟...


资料来源:官方ppt和发布会以及个人瞎猜


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