前言 核酸提取可谓是分子生物学实验中的基础实验了,做分子实验的伙伴们应该对它并不陌生,后续的操作比如分子克隆、PCR和qPCR等都是要在核酸的基础上进行,所以将核酸成功地从细胞中分离纯化出来是多数实验的第一步。 在核酸提取过程中,有一种酶是常用的,负责将核酸从细胞中提取出来还不破坏其结构,它就是蛋白酶K(Proteinase K)。 相对于其他的酶(DNA聚合酶、逆转录酶等),蛋白酶K的存在就显得比较低调了,但是在新冠疫情期间,对它的需求量暴增,它的重要性一下被意识到。 蛋白酶K“一战成名”,一起再来深入了解下吧! 01 什么是蛋白酶K 蛋白酶K是一种从白色念珠菌分离出来的蛋白酶,具有稳定的结构、极高的酶活力。 作为一种蛋白酶,它可以起到消化和降解其他蛋白的作用,底物偏好于带有脂肪族及芳香烃的肽链。 蛋白酶K的活性不会被尿素、SDS和EDTA等变性剂抑制;且可以在高温(50~70℃)、高盐或较高的pH(4~12.5)等条件下仍能保持较高活性。 蛋白酶K属丝氨酸蛋白酶类,可以用苯甲基磺酰氟(一种丝氨酸蛋白酶的抑制剂)抑制其作用。 通常蛋白酶K冻干状态在0~4℃保存,溶液状态在-20℃保存。 02 蛋白酶K有哪些应用 20世纪70年代,蛋白酶K从林伯氏白色念球菌的培养基中被分离纯化出来,随后被进行深入研究,并被广泛应用于实验室和工业生产中的许多应用领域,比如医疗诊断、核酸提取、原位杂交、皮革、食品加工、饲料生产和造纸等,其中最为常用的应用还是核酸提取。 在这里先对蛋白酶K在医疗诊断和科研领域上的应用做个简单的介绍。 医疗诊断 在病毒核酸检测中,对病毒样本的运输和检测都是高风险的,因此提前对病毒样本灭活处理非常的重要! 在病毒的采样液中添加蛋白酶K就可以裂解病毒的外壳蛋白并使其失活,这样对于后续的处理就会更安全;另外,蛋白酶K还可以降解RNase以防止病毒RNA降解,这样有利于核酸检测。 核酸提取 在核酸提取时,蛋白酶K能将细胞或组织中的蛋白质降解掉,将核酸从细胞中提取出来;有些核酸结合蛋白与核酸结合地比较稳定,不利于核酸的提取和纯化,蛋白酶K可以将这些蛋白降解,促进核酸分离,这样就可以提高核酸的纯度和收率;另外,蛋白酶K对核酸的降解作用较小,有助于保持核酸的完整性,有利于后续的实验。 RNA是极不稳定且易于被广泛存在的RNase降解,在提取RNA时使用蛋白酶K可以降解RNase从而创造一个无RNase的环境,防止RNA被降解,保证RNA的质量,这对于后续以RNA为基础的实验非常重要。 原位杂交 在原位杂交技术中,蛋白酶K通常用于杂交前的处理,消化包围靶核酸的蛋白质,增加探针与靶核酸结合的机会,提高杂交信号。 |