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正式启动!中国感染高通量测序诊断能力提升行动计划

2021-7-13 00:00| 编辑: 归去来兮| 查看: 1732| 评论: 0|来源: 小桔灯网

摘要: 感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病,传统病原检测方法对于病原不明的疑难危重等感染病原的鉴别诊断存在报告时间较长、检测靶标有限、阳性率较低等局限性,而快速准确的诊断方法是有效治疗、病情检测及 ...


感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病,传统病原检测方法对于病原不明的疑难危重等感染病原的鉴别诊断存在报告时间较长、检测靶标有限、阳性率较低等局限性,而快速准确的诊断方法是有效治疗、病情检测及快速控制患者病情的重要前提。


随着病原宏基因组测序(mNGS)技术的不断发展与完善,mNGS 检测技术不仅在临床感染诊断中得到了广泛应用和认可,并且越来越多的医院计划本地化开展,以便更快地满足临床早期感染病原诊断的需求。目前阶段,mNGS的临床应用存在问题较多,例如技术难度相对较高、操作流程相对复杂、报告解读相对困难、临床应用规范有待提高、室间质评结果差强人意、行业内尚缺乏统一规范的培训机制等。



基于上述背景,由中国初级卫生保健基金会主办、深圳华大因源医药科技有限公司支持的"中国感染高通量测序诊断能力提升行动计划"项目于2021年7月11日在北京丽晶酒店召开项目启动会。在此之前,为更好地落地本项目的进行,分别于2021年5月25日举行了线上筹备会,2021年6月17日-18日开展了线下培训备课会。

本项目计划2021年在四川大学华西医院、复旦大学附属中山医院、东南大学附属中大医院、中国人民解放军总医院、广东省中医院以及北京协和医院共计开展6期培训会,助力mNGS检测技术实现本地化开展,促进检验与临床的多学科互动,提高医院感染性疾病的综合诊疗能力。同时帮助提高 mNGS 相关检测人员的技术水平与资质,更好更快地了解并运用该项检测技术,更有效地实现 mNGS 检测技术本地化的应用价值。


本项目启动会首先由中国科技大学附属第一医院马筱玲教授和四川省人民医院蒋黎教授主持中国医学科学院北京协和医院徐英春教授作为大会主席做开场致辞,提出mNGS在新冠的早期发现及新发罕见病原体的检测中发挥了重要作用,在疑难感染性疾病诊断中的价值毋庸置疑,但是mNGS在临床感染诊断应用中的发展需要大家一起携手共同推进。中国初级卫生保健基金会张琪主任做基金会领导至辞,表示基金会将全力把工作做好做实,与各位专家共同努力,通过该项目的开展切实有效地提高医院对于感染性疾病的诊疗能力,从而及时有效的治疗疾病,降低病患成本、提高生命质量。

深圳华大因源医药科技有限公司营销总监徐晓玲女士做企业代表致辞,提及华大基因参与人类基因组计划到2003年参与抗击SARS的历史,再到新冠疫情期间利用基因科技助力抗疫。华大基因一直都是一个有家国情怀,有社会责任感的企业。希望借助本项目的不断推进,和各医疗机构及相关单位一起推动mNGS技术在临床的规范化合理应用。

之后中国医学科学院北京协和医院徐英春教授、复旦大学附属中山医院胡必杰教授、东南大学附属中大医院吴国球教授、中国人民解放军总医院张樱教授、四川大学华西医院王婧教授、中国初级卫生保健基金会张琪主任、深圳华大因源医药科技有限公司营销总监徐晓玲女士进行"中国感染高通量测序诊断能力提升行动计划"项目启动仪式。


接下来,由同济大学附属肺科医院余方友教授作为主持,中国医学科学院北京协和医院张栋老师从项目背景、项目内容、项目方案和项目进展等方面对该项目进行了介绍,并明确提出了本项目的三个主要目标:教学单位mNGS能力的提升、参加培训单位的mNGS能力提升以及mNGS行业检测能力的提升


然后,由北京中日友好医院鲁炳怀教授和复旦大学附属中山医院胡必杰教授作为主持,同济大学附属东方医院温东华教授、四川大学华西医院王婧教授分别为我们带来了mNGS性能确认的主题分享。温东华教授从性能验证与性能确认的定义、何时做性能确认、如何做二代测序的性能验证、病原微生物高通量基因检测(新型冠状病毒)的性能确认等方面进行了汇报,并分享了自己在mNGS性能确认过程中的收获。王婧教授分享了四川大学华西医院病原微生物高通量基因检测性能验证方案及结果汇总。与会的各位专家就mNGS性能确认方案如何制定展开了热烈的讨论。

mNGS的检测结果与人源背景、数据量、病原微生物种类等都有关,所以像传统检测方法一样对于常见病原微生物进行验证的意义和价值仍需要商榷。而mNGS更多用于常规检测方法检测不出或很难检出的病原微生物,所以针对不同的样本、不同的病原微生物,应该制定不同的规则来进行确认。

然后,由山东省临床检验中心卢志明教授和东南大学附属中大医院吴国球教授作为主持,进行了“背景库和LOD讨论”的主题讨论,全体嘉宾就该主题展开了热烈的讨论。提出不同的病原种类LOD存在差异,相同的病原在不同人源比情况下LOD可浮动,LOD的确认依赖于实验室已建立明确的Cutoff值,Cutoff值的建立依赖于实验室已建立完善的背景核酸模型。不同的实验室在建立背景核酸数据模型时,需要考虑地区、样本类型、季节等因素,各个医院可借助本次计划的实施过程,完成各个实验室背景数据模型的辨根识源。

最后,由中国人民解放军总医院张樱教授作为主持,大会主席中国医学科学院北京协和医院徐英春教授做大会总结致辞。mNGS近年来爆发式地出现,很多医生也给予mNGS很多的期望,但mNGS的临床应用仍然有很多问题需要解决,这些问题也是我们在"中国感染高通量测序诊断能力提升行动计划"实施过程中希望解决的问题。感谢参与该项目的每个医院、每位医生,希望各位专家带着责任感与使命感,携手共进,让该技术的临床应用逐渐规范化和标准化。

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