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重磅丨新型冠状病毒全基因组mNGS试剂盒问世!

2020-2-17 00:00| 编辑: 班木芙兰| 查看: 2877| 评论: 0|来源: 小桔灯网

摘要: 自去年底以来,新型冠状病毒疫情成为中国乃至全世界的关注焦点,杰毅生物作为病原体分子检测整体解决方案的研发、生产和服务企业,积极承担社会责任,面对疫情快速响应。_按照2月4日,国家卫生健康委员会办公厅、国 ...


自去年底以来,新型冠状病毒疫情成为中国乃至全世界的关注焦点,

杰毅生物作为病原体分子检测整体解决方案的研发、生产和服务企业,积极承担社会责任,面对疫情快速响应。

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按照2月4日,国家卫生健康委员会办公厅、国家中医药管理局办公室发布推荐阅读

《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第五版)》,RT-PCR和基因测序是新冠病例确诊标准。



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传统针对病毒基因测序检测(mNGS)是通过随机引物对于样本进行无差别的逆转录,然后将得到的DNA进行建库和测序。


然而临床样本中,人源细胞背景高,同时病毒含量在不同样本中差别很大,当病毒载量较低时,基因组覆盖度往往较低,难以对病毒可能的变异进行全面的监控和溯源。


对于此次新冠病毒,希望在鉴定病原体同时可以快速、低成本地最大限度获得病原体全基因组序列,这对于常规方式的mNGS来说挑战非常大。

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鉴于此,杰毅生物的研发人员针对新型冠状病毒设计了全新的mNGS方案,在全面鉴定病原体的同时,特别设计了一系列新冠病毒特异性引物,并结合杰毅生物独特的PCR-free快速建库方法,推出了新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止测序法)。

新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(可逆末端终止测序法)


该试剂盒可以直接从临床样本开始操作,大大提高新冠病毒核酸富集效率,在和荧光定量CT<37确诊样本对比中,不仅阳性符合率比传统mNGS从87.5%提高到100%,基因组覆盖度更是最高达到99.8%。


本试剂盒与常规RNA-seq试剂盒“新冠病毒”高通量测序结果比较


除试剂盒外,该解决方案配备了Cubics™病原宏基因组一站式建库仪和本地化数据分析软件从临床样本至测序文库,全流程无人值守自动化,用时3.5小时。 


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杰毅生物的新型冠状病毒全基因组mNGS解决方案,有以下特点

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自动化

Cubics™一站式建库仪,具有4个独立反应通道,可放置在生物安全柜内无人值守地完成核酸提取、建库和纯化的全流程。样本进,文库出,有效杜绝样本间交叉污染和实验人员的感染风险;

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速度快

从临床样本(咽拭子、痰液、肺泡灌洗液)至文库耗时3.5小时,从核酸至文库耗时3小时,显著提升“新冠病毒”高通量测序的时效性(常规方法建库耗时9-11小时)。测序数据分析在本地自动化运行,耗时1小时左右;

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成本低

在每个样本测序20M(两千万条)序列,75bp读长的条件下,“新冠病毒”基因组覆盖度最高可达99.8%,显著提高测序仪利用率,降低测序成本;

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覆盖广

除“新冠病毒”外,可同时检测样本中16000余种DNA病原体(细菌、DNA病毒、真菌、寄生虫等),对临床重症患者提供精准和全面的感染诊断。


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