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[分享] 标准品的构建与相关知识点

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发表于 2013-11-26 10:57 | 显示全部楼层 |阅读模式

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举例:标准品的构建
一般荧光定量的基本的计算如下

一、用标准曲线法定量模板浓度
用一系列已知浓度的标准品制作标准曲线,在同等条件下目的基因测得的荧光信号量同标准曲线进行比较,从而得到目的基因的量。

二、外标准品的制备
(1)化学合成目的基因,它的优点是纯度高、定量准确,缺点是受化学合成工艺的限制,只能合成120bp以下的长度。
(2)将PCR扩增产物直接梯度稀释,它的优点是方便、简单,缺点是不准确、不稳定,容易造成污染。
(3)将PCR产物克隆到载体上,然后抽提出质粒,经过测量浓度和拷贝数的换算,可准确定量,它的优点是稳定、准确。
我们实验室都用第三种方法,相对简单、便宜。

三、质粒 拷贝数的计算
拷贝数=(质量÷分子量)×6.0×1023。
(1)每个碱基的平均分子量是324.5,质粒的分子量是324.5*3560*2=2310440,10μg质粒的摩尔数是10/2310440/1000000=4.328e-12,一摩尔等于6.023e+23,则10μg质粒有4.328e-12*6.023e+23=2.607e+12拷贝。
(2)一对碱基的分子量为660Da,重量为1e-15μg,则10μg质粒拷贝数=10/(1e-15*3560)=2.7e+12分子。
(3)例如pGEM-T 载体长3003bp,插入的目的片断长162bp,每个碱基的平均分子量是330,(每对碱基/bp是660,)质粒原液约250μg/mL,阿弗加德罗常
数(每mol 的微粒数)是6.02×1023/mol。那么每2μl 的绝对模板数量是:

=14.4×1010
所以,10-4~10-7 质粒的模板分子数是14.4×106~103。

四、 结果计算
在实时定量PCR 技术中,每个模板的Ct 值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct 值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中纵坐标代表起始拷贝数的对数,横坐标代表Ct 值。因此,只要获得未知样品的Ct 值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。


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发表于 2013-11-27 10:53 | 显示全部楼层
收藏学习了,我觉得可以把主帖看做一个标准品构建与溯源的SOP,后面的跟帖是修改意见,如果能够完善成让行业内都认可的SOP,就功德无量了

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发表于 2013-11-26 12:00 | 显示全部楼层
顶一个。学习了~可以看看
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发表于 2013-11-26 12:17 | 显示全部楼层
标准品溯源是个难题,尤其是在没有国家标准物质和参考程序的情况下
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发表于 2013-11-26 12:44 | 显示全部楼层
标准品溯源是个非常麻烦的事情。源的确定已经不是一个简单的事情了,还要继续确认如何追溯,如果把一级一级的传承关系搞清楚了,这个事情看着会简单很多,但是做好却很难。需要储备大量的背景知识,有丰富的经验,是个需要慢慢摸索的过程

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发表于 2013-11-26 13:01 | 显示全部楼层
标准品溯源是个难题
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发表于 2013-11-26 16:07 | 显示全部楼层
嗯~对标准品溯源还属于看起来简单的阶段。就是一级一级的测定,传承

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发表于 2013-11-26 16:17 | 显示全部楼层
呃。。。。不明觉厉。。。不算灌水吧
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发表于 2013-11-26 16:54 | 显示全部楼层
标准品的溯源,什么才是最可靠的源泉?溯源条件的判定标准是什么?溯源问题要怎么解决,是不是所有的指控和定标都有溯源文件?这个以后应该会越来越完善吧!

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发表于 2013-11-27 11:06 | 显示全部楼层
必须做但是难做的事
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发表于 2013-11-27 13:37 | 显示全部楼层
标准品溯源是很难做的,如何制定溯源的操作方法、标准等等。而且每种物质的方案都是不太相同的,就意味着要做很多验证

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发表于 2013-11-27 17:10 | 显示全部楼层
外购大家都是走的什么途径?希望多分享经验。
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发表于 2013-11-28 13:34 | 显示全部楼层
如何控制住标准品和质控品的稳定性,有经验吗?
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发表于 2013-11-28 14:29 | 显示全部楼层
芸豆荚 发表于 2013-11-28 13:34
如何控制住标准品和质控品的稳定性,有经验吗?

冻干之~~
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发表于 2013-12-30 11:47 | 显示全部楼层
没有参考品和参考程序的如何溯源,有统一的标准就好了
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发表于 2014-5-23 23:10 | 显示全部楼层
谢谢楼主的无私奉献
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发表于 2014-5-23 23:17 | 显示全部楼层
学习了。谢谢。。
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发表于 2014-8-29 20:28 | 显示全部楼层
外标的溯源有没有资料?
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发表于 2017-2-13 11:17 | 显示全部楼层
这种是我想要的资料,很好
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发表于 2017-3-2 14:26 | 显示全部楼层
无标的标准品如何构建及朔源,头大
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