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[分享] IVD知识文库系列-11.9微生物检测の艰难梭菌

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发表于 2018-3-27 17:29 | 显示全部楼层 |阅读模式

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编者按:
本次章节新增篇章,为艰难梭菌的科普篇章。
包含了:成人艰难梭菌共识及梅里埃相关产品的解读。
关键词:艰难梭菌、专家共识、梅里埃。
其意义在于站在市场的视角去了解艰难梭菌检测的侧重点,从“独角兽”梅里埃的产品角度去解读艰难梭菌的推广特色。
小编语录:以专家共识的角度去知道一线客户的使用习惯,从而完善研发立项。
从“独角兽”梅里埃的角都去探索产品的特点,从而优化研发升级。
引入阴性预测值NPV和阳性预测值PPV的概念,98%阴性预测值上一次出现的项目叫做HPV,又名人乳头瘤病毒。
用临床听得懂的话去描述产品,有助于上量,更有助于产品的推广。
而NPV对于预筛的价值最大,在两步法之中,谷氨酸脱氢酶(GDH)阴性预测值95%-100%,毒素ELA 阴性预测值98%。
GDH+毒素ELA可以排除艰难梭菌感染,临床价值在于阴性预测值≥98%。
什么是艰难梭菌?
艰难梭菌(Clostridium difficile, CD)是一种革兰阳性、产毒素或非产毒素的厌氧芽孢杆菌,其中产毒性CD 是院内肠道感染的主要致病菌之一。
艰难梭菌感染(Clostridium difficile infection, CDI)多发生于应用抗菌药物的老年患者,临床上轻者引起腹泻,严重者引起假膜性肠炎,甚至死亡。
近年来,CDI的发生率和病情严重程度不断增高,识别由艰难梭菌引起的AAD仍是临床上的一个难点,粪移植为复发型CDI的治疗带来突破性进展。
美国医疗保健流行病学学会/美国感染病学会(SHEA/IDSA)2010年 、欧洲临床微生物与感染性疾病学会(ESCMID)2009年 、2013年,美国胃肠病学会(ACG)2013年均发表了CDI的诊疗指南。
中国于2017年发表《中国成人艰难梭菌感染诊断和治疗专家共识》。
附:各国CDC疾控数据。
美国疾病控制和预防中心(CDC) 在 2013 年发布的统计数据显示: 美国每年CDI患者超过2 5 万,其中至少1 .4万人死于该种疾病。加拿大CDI发病率从1997年的3. 8/万住院日上升至2005年的9. 5/万住院日。2007至2008年中国上海一家医院的研究发现,其住院患者CDI的发病率为17. 1/万住院患者。
在中国,引起感染的CD有其独特的流行病学特征,主要流行菌株为 RT017 (ST3 7 ),RT046 (ST3 5 ) 和 RT012(ST54)。而中国健康人分离的CD则以多位点序列分型ST5 4 、ST3 和ST2 为主。
艰难梭菌的易感人群及临床治疗思路
发病机制:
艰难梭菌感染CDI既需要获得艰难梭菌,也需肠道微生物群存在破坏。艰难梭菌引起症状性感染的确切机制,尚不清楚。 这种微生物是非侵袭性的,产生毒素是致病的关键(非产毒艰难梭菌菌株不引起腹泻)。
毒素通过微管及细胞间紧密连接破坏上皮完整性,引起诸如IL-8等炎性介质的释放。这些作用促进结肠黏膜的炎性浸润、促进引起腹泻的液体转移,促进上皮坏死。
易感人群:
抗生素破坏微生态,增加CDI危险。
CDI相关的其他因素包括年龄较大、近期住院、住院时间较长、应用多种抗生素、抗生素疗程较长、质子泵抑制剂、化疗、慢性肾脏病及饲喂管。
实验室诊断:
临床治疗:
1.艰难梭菌感染(CDI)要求存在腹泻(24小时内不成形大便≥3次)或肠梗阻或中毒性巨结肠的影像学证据;以及粪便产毒艰难梭菌或其毒素检查结果阳性,或有假膜性结肠炎的结肠镜或组织病理学证据。
2.实验室检查不能区分定植与感染。
3.仅应在有症状的患者中行CDI检测。
4.CDI诊断检查策略不一。针对液体粪便样本,采用集合酶链反应(PCR)检测毒素基因的多步法或单步法PCR法,敏感性及特异性最高。
4.不推荐在CDI治疗后进行(判断是否)治愈的检查。
常见的艰难梭菌检测方法
(资料来源《中国成人艰难梭菌感染诊断和治疗专家共识》)
1 . 粪便标本采集
一般情况下,仅需对稀便、水样便或半成形便进行CD检测。
对于疑似有CD感染及肠梗阻的患者,应通过直肠拭子进行检测。
在出现明显腹泻症状(>3次/24h、持续超过2d) 及进行针对性治疗前,采集不成形粪便标本(推荐10~20ml,不少于5 ml) 送检。CD毒素室温下易降解,应于取材后2h内送检并立即检测;如不能立即检测,则需将标本置于4丈冰箱保存,不超过3d。
2 . 艰难梭菌菌株检测
( 1 ) 培养
常米用 CCFA ± 培养基(CCFA) 或CD显色培养基进行厌氧培养。CCFA培养基需培养48-72h,对粪便标本通过加热或乙醇预处理可以减少粪便正常菌群,筛选出细菌芽孢。
( 2 )谷氨酸脱氢酶检测
谷氨酸脱氢酶(GDH)是所有CD高水平表达的代谢酶,可用于筛查疑似CDI患者粪便样本中是否存在CD。
通常使用酶免疫方法EIAs 直接检测粪便标本中的GDH抗原。检测时间约1-2h,操作简便且成本较低。
系统综述显示该试验具有较高的敏感度〉90% 、特异性> 90%和阴性预测值95%-100% ,但同CD培养一样,不能区分菌株是否产生毒素。
3 . 艰难梭菌毒素检测
( 1 ) 细胞毒性试验
细胞毒性试验(CCTA) ,即细胞毒性中和试验(CCNA) ,用于直接检测粪便标本中存在的CD毒素。
CCTA是实验室诊断CD的金标准,特异性强,敏感度高,最低可检测出10pg毒素,但需要细胞培养及显微镜观察的相应设施和技术,操作繁琐,耗时长48-72h。
( 2)产毒素培养
产毒素培养(TC) 用于检测CD菌株的产毒素能力。将不成形稀便标本接种于CCFA,培养基或CD显色培养基上,厌氧培养至少48 h,挑取典型菌落接种至液体培养基中,厌氧培养48 h,也可用EIAs检测固体培养基上菌落产毒素能力,检测时间可缩短至2 -3d,但敏感度稍低。
( 3 ) 毒素免疫检测
目前常用EIAs直接检测腹泻粪便标本中的CD毒素,用单克隆抗体特异性结合CD A/ B 毒素蛋白进行检测。EIAs检测毒素的优点是特异性高(>90%) ,能区分产毒株和非产毒株,并且检测周期短,数小时即可出结果,操作简便。
目前, eias检测CD毒素常和GDH检测或核酸扩增技术(NAATs) 联合应用,用于CD感染实验室两步法或三步法诊断。
4 . 艰难梭菌毒素基因检测
可采用实时PCR或环介导等温扩增法(LAMP) 等分子生物学技术,定性检测粪便样本中的CD毒素基因。商品化的检测系统包括 GeneXpert ( Cepheid,美国)、FilmArray(梅里埃,法国)等,此类方法将样品提取、纯化、核酸扩增、产物自动化检测整合,通常可在2h内完成检测。
“独角兽”梅里埃在艰难梭菌的应用
(资料来源百度文库)
“独角兽”梅里埃在艰难梭菌检测类项目所提供的是一个套餐形式,全方位个性化的整体解决方案。
从检测试剂类产品方向来看,用一线临床的术语来说,是涉及到了预筛(筛查),诊断(毒性检测、细菌培养)、鉴别诊断(鉴定)、预后与个性化用药(细菌药敏)、跟踪随访(监测)。
从产品条线,用一张流程图,一目了然的告诉医院临床科室,“独角兽”梅里埃的产品涵盖了临床各个阶段的需求点。
引入阴性预测值NPV和阳性预测值PPV的概念,98%阴性预测值上一次出现的项目叫做HPV,又名人乳头瘤病毒。
用临床听得懂的话去描述产品,有助于上量,更有助于产品的推广。
而NPV对于预筛的价值最大,在两步法之中,谷氨酸脱氢酶(GDH)阴性预测值95%-100%,毒素ELA 阴性预测值98%。
GDH+毒素ELA可以排除艰难梭菌感染,临床价值在于阴性预测值≥98%。
从检测仪器类产品方向来看,用一线检的术语来说,是涉及到了急诊筛查(IDAS+CDAB),检验公认金标准诊断(chromID™ C. difficile agar)、快速鉴别诊断(VITEK® 2 ANC card+API® 20A & rapid ID 32A)、预后与个性化用药(ATB™ ANA+DiversiLab® C. difficile)。
从产品条线,用一张流程图,一目了然的告诉医院检验科室,“独角兽”梅里埃的产品涵盖了临床各个阶段的需求点,并且是全自动化的产品,保证了产品的快速与智能兼备。
“独角兽”梅里埃为客户规划一份建议书
(资料来源百度文库)
用政策和行业数据描述微生物实验室现状
以“蚁穴”—标本培养导入微生物建设的规范性和必要性
一句话概括临床工作核心,以工作中心来凸显梅里埃产品的价值点
革兰染色的质量就是报告的质量基础
经济又全面的药敏是微生物鉴定的需求点
中小型医院的药敏可当日报告亦是需求

来源:小桔灯网  作者:纳兰烙烙
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