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[分享] cfDNA全基因组测序

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发表于 2016-5-30 13:51 | 显示全部楼层 |阅读模式

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cfDNA全基因组测序
循环的游离DNA可作为癌症诊断与多种临床检测的生物标记。转化基因组研究利用循环游离DNA监测基于特异性肿瘤的个性化治疗方案。为了研究这一宝贵信息,从全血中检测到低水平的cfDNA是关键。
Swift Biosciences的Accel-NGS® 2S PCR-Free DNA Library Kit 经过验证,cfDNA上样量10ng时,构建文库可不用PCR。相对较少cfDNA末端损伤与cfDNA片段较窄尺寸分布,促成了低起始量PCR-free文库的构建。
酶促法片段化血液中cfDNA相比机械片段化,末端碱基损伤较小。对于机械化打断的DNA,Accel-NGS® 2S PCR-Free的5’与3’末端修复能够减少一些末端损伤。然而,不能修复的损伤片段末端妨碍了接头的链接,在最终文库构建完毕时也不能恢复。因此,相对较少的cfDNA末端损伤,更可能成功构建成文库分子,上样的DNA分子能够更高效率的转化成有用文库。
优势:
·cfDNA文库构建从10ng开始可不用PCR;
·更低的起始量就可以保证文库的多样性;
·最小化AT-或CG-富集区测序的偏向性。

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发表于 2016-6-6 10:25 | 显示全部楼层
有详细资料吗?
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 楼主| 发表于 2016-6-13 16:38 | 显示全部楼层
qq2073904839私聊
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发表于 2017-8-19 09:49 | 显示全部楼层
好好学习一下
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